More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1778 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 475 aa  924    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 		 502 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 507 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 461 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 501 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 497 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  28.32 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 526 aa  107  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 516 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 469 aa  103  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 485 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  31.27 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 497 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 485 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 462 aa  95.1  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 440 aa  94.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 484 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 		 495 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 495 aa  91.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 456 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 		 509 aa  90.5  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 492 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 492 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 492 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 485 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 456 aa  87  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 		 504 aa  87  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  27.58 
 
 		 489 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 490 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27.41 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  28.27 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 455 aa  83.2  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  29.37 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 486 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  23.16 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  27.65 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  30.73 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  22.73 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  31.08 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  28.76 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  25.31 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  26.2 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  24.77 
 
 		 471 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  24.77 
 
 		 471 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.24 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25.78 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  29.46 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  29.46 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  30.59 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  30.59 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  25.16 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  29.46 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  30.59 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>