More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02383 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  100 
 
 		 458 aa  894    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  54.29 
 
 		 456 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  54.07 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  56.15 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  53.73 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  40.32 
 
 		 485 aa  299  8e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  31.15 
 
 		 510 aa  196  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  30.5 
 
 		 513 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 		 506 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  28.91 
 
 		 497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 517 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  29.63 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  29.36 
 
 		 516 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 513 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  27.55 
 
 		 553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  28.66 
 
 		 535 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 484 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 503 aa  146  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 507 aa  126  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 511 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 517 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0935  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 513 aa  87  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1181  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 469 aa  86.7  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.89 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  23.56 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1487  amino acid transporter  24.72 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.838437  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  27.41 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0719  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.544014  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0867  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  25.46 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  25.42 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  25.23 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  25.46 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  25.23 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  25.23 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  25.23 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  25.23 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25.27 
 
 		 456 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  28.09 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  24.17 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 470 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  25 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1639  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00236467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  27.09 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  23.17 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  24.52 
 
 		 452 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  24.52 
 
 		 452 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  24.52 
 
 		 452 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  24.52 
 
 		 452 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 452 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  24.52 
 
 		 452 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 453 aa  67  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  24.52 
 
 		 452 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  24.52 
 
 		 452 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  24.52 
 
 		 452 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  24.52 
 
 		 452 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  24.52 
 
 		 452 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>