More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3054 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  88.2 
 
 		 497 aa  839    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 506 aa  1000    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  49.69 
 
 		 516 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  48.27 
 
 		 510 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  47.73 
 
 		 476 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  47.19 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  49.36 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  43.04 
 
 		 517 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  43.72 
 
 		 516 aa  362  6e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  40.34 
 
 		 553 aa  352  1e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  40.72 
 
 		 535 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  40.52 
 
 		 535 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  40.32 
 
 		 513 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  41.21 
 
 		 507 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  40.94 
 
 		 513 aa  336  5e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  39.92 
 
 		 512 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  41.54 
 
 		 511 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  38.54 
 
 		 517 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  40.76 
 
 		 524 aa  319  7e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  40.92 
 
 		 508 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 		 484 aa  287  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  32.04 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  31.7 
 
 		 456 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  31.46 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  30.39 
 
 		 485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  30.02 
 
 		 458 aa  170  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  25.68 
 
 		 465 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  24.66 
 
 		 456 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 		 501 aa  94.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.97 
 
 		 456 aa  94  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 455 aa  90.5  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1181  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 469 aa  88.6  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.24 
 
 		 449 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25.48 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 521 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 521 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  23.64 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  23.61 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 443 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  25 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  22.54 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  22.54 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  25 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  22.53 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  23.15 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 770 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  22.93 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  23.96 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.02 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  22.93 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  25.72 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 468 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  22.27 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  22.02 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  21.59 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  22.02 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  22.02 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  21.59 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  22.7 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  21.88 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  22.02 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  21.88 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  21.96 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  22.7 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  21.46 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  21.58 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  22.33 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  23.56 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 538 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  23.1 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>