More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4908 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 484 aa  921    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  67.29 
 
 		 508 aa  599  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  54.47 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  41.65 
 
 		 516 aa  342  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  40.97 
 
 		 506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  38.62 
 
 		 503 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  40.71 
 
 		 510 aa  298  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  38.44 
 
 		 476 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  41.71 
 
 		 497 aa  294  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  40.04 
 
 		 494 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  36.89 
 
 		 516 aa  286  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  36.29 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  37.06 
 
 		 517 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  33.89 
 
 		 507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  36.56 
 
 		 511 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 		 513 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 		 535 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  34.24 
 
 		 535 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  34.67 
 
 		 512 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  34.11 
 
 		 517 aa  229  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  34.38 
 
 		 524 aa  219  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  27.9 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25.06 
 
 		 456 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  27.77 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 454 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 485 aa  83.2  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  31.55 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  25.67 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  22.62 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  22.84 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  24.1 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  29.7 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0935  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  23.25 
 
 		 510 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  23.65 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.95 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 		 539 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  29.92 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.61 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 455 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  25.28 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.01 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  22.02 
 
 		 513 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 		 486 aa  67  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  22.44 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  26.04 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  22 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  25.49 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  22.74 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  22.47 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  28.21 
 
 		 468 aa  63.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  21.58 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.88 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 538 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>