More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0773 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 516 aa  1014    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  65.23 
 
 		 503 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  71.43 
 
 		 494 aa  626  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  66.46 
 
 		 476 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  50.55 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  47.98 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  46.8 
 
 		 516 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  48.34 
 
 		 497 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  47.12 
 
 		 517 aa  388  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  44.09 
 
 		 553 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  43.68 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  43.21 
 
 		 517 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  41.98 
 
 		 535 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  41.17 
 
 		 535 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  41.17 
 
 		 513 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  44.35 
 
 		 524 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  41.17 
 
 		 512 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  40.86 
 
 		 513 aa  342  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  41.7 
 
 		 511 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  42.56 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  41.65 
 
 		 484 aa  318  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  30.29 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 456 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 456 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  29.85 
 
 		 458 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  28.13 
 
 		 456 aa  127  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  28.37 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 		 443 aa  117  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  27.51 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 443 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 443 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  25.11 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  25.17 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  24.94 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  25 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  25 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  25 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  25 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 456 aa  99.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 453 aa  98.6  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 450 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 449 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0973  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 651 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  28.47 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27.99 
 
 		 449 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 449 aa  94.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  23.21 
 
 		 466 aa  94.4  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 450 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 450 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  25.12 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  24.94 
 
 		 465 aa  89.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 453 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  26.58 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 453 aa  89.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 549 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  26.2 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  26.2 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  26.2 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  26.2 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  26.2 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  26.92 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  26.92 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  26.92 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  26.92 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  26.92 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  26.92 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  26.92 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.56 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.56 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.56 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.56 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.56 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.56 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  25.94 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.28 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 		 465 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 473 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.3 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3470  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0308593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2130  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 643 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.345831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>