More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0710 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  100 
 
 
513 aa  1006    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  56.24 
 
 
508 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  53.64 
 
 
484 aa  438  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  42.28 
 
 
510 aa  346  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  41.13 
 
 
516 aa  342  8e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  39.38 
 
 
503 aa  329  9e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  42.01 
 
 
497 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  38.9 
 
 
516 aa  324  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  41.29 
 
 
506 aa  322  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  38.4 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  39.22 
 
 
517 aa  309  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  39.63 
 
 
494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  37.5 
 
 
553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  37.69 
 
 
511 aa  299  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  35.54 
 
 
513 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 
512 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  35.74 
 
 
535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  35.74 
 
 
535 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  36.91 
 
 
507 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  35 
 
 
517 aa  269  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  35.65 
 
 
524 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  30.44 
 
 
485 aa  169  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  30.63 
 
 
458 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 
456 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 
456 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  31.06 
 
 
455 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 
454 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 
462 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  25.99 
 
 
460 aa  94.7  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  24.39 
 
 
466 aa  90.1  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  23.04 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.52 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  21.41 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0935  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 
513 aa  81.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  21.41 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 
492 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  23.59 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  23.85 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 
501 aa  79.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 
449 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.6 
 
 
449 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 
475 aa  79.3  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  25.65 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  24.21 
 
 
449 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 
440 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  21.28 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  26.25 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  20.77 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  21.28 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  23.36 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  21.28 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  22.94 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  22.41 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  20.51 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  22.99 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  20.51 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  22.53 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  20.51 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  20.51 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  21.79 
 
 
456 aa  73.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 
521 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  21.35 
 
 
449 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1181  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  25.3 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  26.43 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  25.73 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  22.66 
 
 
521 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  22.66 
 
 
521 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 
506 aa  70.1  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  23.88 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 
491 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  26.17 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  24.11 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  25.81 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 
477 aa  68.6  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  21.28 
 
 
516 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>