More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0679 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 517 aa  1027    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  58.38 
 
 		 510 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  59.39 
 
 		 516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  52.13 
 
 		 553 aa  509  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  52.01 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  52.01 
 
 		 535 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  52.01 
 
 		 513 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  52.05 
 
 		 512 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  51.4 
 
 		 507 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  49.26 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  50.41 
 
 		 511 aa  455  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  50.74 
 
 		 524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  47.12 
 
 		 516 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  43.12 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  41.85 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  43.76 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  43.52 
 
 		 506 aa  364  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  43.4 
 
 		 497 aa  362  6e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  39.88 
 
 		 513 aa  327  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  36.85 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  36.1 
 
 		 508 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  27.03 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 466 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  24.88 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 502 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 502 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 511 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  25.07 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  23.17 
 
 		 507 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  25.38 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.93 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  27.84 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0973  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 651 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  28.49 
 
 		 465 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 516 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  24.15 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  22.03 
 
 		 501 aa  77.4  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  21.8 
 
 		 453 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 465 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  24.02 
 
 		 463 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 443 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  23.28 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.55 
 
 		 449 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 518 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 538 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.37 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  22.78 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25.11 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  22.17 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 486 aa  73.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  28.32 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  22.49 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  23.92 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  24.75 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  25.06 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0935  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  21.96 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  21.79 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  25.99 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 521 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 549 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.81 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  25.93 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  24.14 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>