More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0758 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  86.45 
 
 		 517 aa  858    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 524 aa  1039    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  57 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  56.79 
 
 		 535 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  56.82 
 
 		 513 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  58.44 
 
 		 512 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  59.96 
 
 		 511 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  58.98 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  55.89 
 
 		 510 aa  535  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  52.6 
 
 		 553 aa  524  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  51.78 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  50.51 
 
 		 517 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  45.22 
 
 		 516 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  45.19 
 
 		 494 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  43.27 
 
 		 476 aa  356  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  43.13 
 
 		 503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  42.03 
 
 		 497 aa  341  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  41.36 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  35.73 
 
 		 513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  33.6 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  34.23 
 
 		 484 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  26.49 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  22.44 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 477 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  23.5 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  23.14 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 549 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  22.39 
 
 		 502 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  23.35 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  22.39 
 
 		 511 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  23.35 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  22.39 
 
 		 502 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  23.78 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  22.73 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  21.9 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  21.9 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  24.73 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  24.15 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  22.59 
 
 		 496 aa  67  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  24.69 
 
 		 464 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  24.36 
 
 		 440 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  24 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0935  amino acid permease-associated region  23.48 
 
 		 513 aa  65.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  23.79 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  29.64 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  22.42 
 
 		 507 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  21.44 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  24 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  21.69 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  24 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  22.86 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  22.93 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 566 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  25.28 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  22.38 
 
 		 449 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  24.26 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 462 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  26.49 
 
 		 470 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  24.02 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  24.25 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>