222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0935 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0935  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 513 aa  1020    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1181  amino acid permease-associated region  40.89 
 
 		 469 aa  259  6e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0867  amino acid permease-associated region  39.39 
 
 		 469 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0719  amino acid permease family protein  39.39 
 
 		 469 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.544014  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  21.02 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  20.55 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  20.37 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  23.08 
 
 		 458 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  21.51 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  22.84 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  22.46 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  23.19 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  23.68 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  25.07 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  23.01 
 
 		 466 aa  57  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 487 aa  57  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  22.9 
 
 		 553 aa  56.6  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  20.67 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  22.68 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.2 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2938  gamma-aminobutyrate transporter  28.1 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.111546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2990  gamma-aminobutyrate transporter  28.1 
 
 		 466 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  22.7 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2973  gamma-aminobutyrate transporter  28.1 
 
 		 466 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  0.0482196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3095  gamma-aminobutyrate transporter  28.1 
 
 		 466 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2906  gamma-aminobutyrate transporter  28.1 
 
 		 466 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  24.33 
 
 		 468 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  22.36 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 486 aa  53.9  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  23.13 
 
 		 476 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 485 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  21.94 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  23.32 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3276  GABA permease  26.74 
 
 		 461 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  30.93 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3218  gamma-aminobutyrate transporter  28.4 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  23.14 
 
 		 524 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  23.95 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  19.35 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02519  gamma-aminobutyrate transporter  28.4 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1020  GABA permease  28.4 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  21.92 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2783  gamma-aminobutyrate transporter  28.4 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.414998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0583  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0404374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02483  hypothetical protein  28.4 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1043  gamma-aminobutyrate transporter  28.4 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2798  gamma-aminobutyrate transporter  28.4 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2943  gamma-aminobutyrate transporter  28.4 
 
 		 466 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3905  gamma-aminobutyrate transporter  28.4 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.667666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0313  GABA permease  26.97 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  23.05 
 
 		 477 aa  51.2  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  36.17 
 
 		 508 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  21.63 
 
 		 458 aa  51.2  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0344  amino acid permease family protein  25.83 
 
 		 465 aa  51.2  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  23.36 
 
 		 480 aa  50.8  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 		 458 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  27.31 
 
 		 542 aa  50.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1676  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 469 aa  50.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  22.87 
 
 		 478 aa  50.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4926  GABA permease  26.78 
 
 		 461 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 467 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  26.76 
 
 		 467 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  24.29 
 
 		 483 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5276  proline-specific permease proY  27.86 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5356  gamma-aminobutyrate permease  26.18 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  23.78 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4909  GABA permease  27.04 
 
 		 463 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  23.39 
 
 		 543 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  21.92 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  22.39 
 
 		 481 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3570  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 487 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  21.92 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  21.37 
 
 		 476 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  22.88 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  21.05 
 
 		 501 aa  50.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0094  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 353 aa  50.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  23.53 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.18 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>