More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2906 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02519  gamma-aminobutyrate transporter  91.85 
 
 
466 aa  859    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1020  GABA permease  92.06 
 
 
466 aa  861    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2798  gamma-aminobutyrate transporter  92.06 
 
 
466 aa  861    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2938  gamma-aminobutyrate transporter  99.57 
 
 
466 aa  925    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.111546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3905  gamma-aminobutyrate transporter  91.85 
 
 
466 aa  859    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.667666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2990  gamma-aminobutyrate transporter  100 
 
 
466 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3218  gamma-aminobutyrate transporter  91.85 
 
 
466 aa  857    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1043  gamma-aminobutyrate transporter  92.06 
 
 
466 aa  861    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2783  gamma-aminobutyrate transporter  92.06 
 
 
466 aa  861    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.414998 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2943  gamma-aminobutyrate transporter  91.85 
 
 
466 aa  858    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3095  gamma-aminobutyrate transporter  100 
 
 
466 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2973  gamma-aminobutyrate transporter  100 
 
 
466 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  0.0482196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02483  hypothetical protein  91.85 
 
 
466 aa  859    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2906  gamma-aminobutyrate transporter  100 
 
 
466 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2911  GABA permease  70.54 
 
 
463 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2872  GABA permease  71.69 
 
 
463 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2780  GABA permease  70.09 
 
 
463 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5356  gamma-aminobutyrate permease  67.11 
 
 
463 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4909  GABA permease  66.88 
 
 
463 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0302  GABA permease  66.59 
 
 
461 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0284  GABA permease  66.59 
 
 
461 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  hitchhiker  0.000157703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0307  GABA permease  66.59 
 
 
461 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220085  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2921  GABA permease  67.67 
 
 
463 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0313  GABA permease  66.08 
 
 
463 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0660  GABA permease  68.24 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3590  GABA permease  67.28 
 
 
541 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.566491  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0956  GABA permease  68.24 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3572  GABA permease  68.24 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1926  GABA permease  68.24 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.620655  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3600  GABA permease  67.28 
 
 
587 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0515  GABA permease  68 
 
 
467 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4926  GABA permease  66.59 
 
 
461 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0494  GABA permease  66.28 
 
 
463 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3609  GABA transporter  66.05 
 
 
463 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0452  GABA permease  66.05 
 
 
463 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131648  normal  0.0220043 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2583  GABA permease  66.05 
 
 
463 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0426  GABA permease  66.05 
 
 
463 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2876  GABA permease  65.97 
 
 
463 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975083  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0522  GABA permease  66.05 
 
 
463 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0205  gamma-aminobutyrate permease  66.82 
 
 
475 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01580  gamma-aminobutyrate permease  66.36 
 
 
475 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683743  normal  0.83882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4114  GABA permease  61.18 
 
 
463 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7767  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2293  GABA permease  60.37 
 
 
468 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114117  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4106  amino acid ABC transporter permease  60.7 
 
 
460 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3679  amino acid permease-associated region  60.47 
 
 
460 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.720671  hitchhiker  0.00000622895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3276  GABA permease  58.98 
 
 
461 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737428  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1758  amino acid permease-associated region  60.7 
 
 
460 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0667  amino acid permease-associated region  58.39 
 
 
464 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.450649  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1805  amino acid permease-associated region  60.14 
 
 
469 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607317  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4627  amino acid permease-associated region  57.79 
 
 
463 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000229605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4765  amino acid permease-associated region  58.01 
 
 
463 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3380  amino acid permease-associated region  60.19 
 
 
460 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4756  amino acid permease  57.56 
 
 
463 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000433889  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3570  amino acid permease-associated region  58.66 
 
 
460 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2214  amino acid permease-associated region  54.34 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2543  amino acid ABC transporter permease  54.34 
 
 
470 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0431573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3171  amino acid permease-associated region  54.34 
 
 
470 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.12607  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2038  amino acid permease-associated region  54.34 
 
 
470 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.948577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3893  amino acid permease-associated region  54.52 
 
 
472 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.375275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4133  amino acid permease-associated region  53.57 
 
 
472 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1317  GABA permease  53.81 
 
 
465 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.319742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3751  GABA permease  50.33 
 
 
487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00254323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3823  GABA permease  53.49 
 
 
464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3774  GABA permease  51.35 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3489  GABA permease  51.35 
 
 
464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3570  GABA permease  51.35 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3468  gamma-aminobutyrate permease  51.35 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3482  gamma-aminobutyrate permease  51.35 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3853  GABA permease  51.35 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.261193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1479  GABA permease  53.47 
 
 
449 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10983  hitchhiker  0.00182133 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2523  amino acid permease-associated region  49.53 
 
 
464 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6223  amino acid permease-associated region  43.59 
 
 
481 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4364  amino acid permease-associated region  45.77 
 
 
476 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0686  beta-alanine/gamma-aminobutyrate-H+ symporter  45.77 
 
 
483 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4525  amino acid permease-associated region  46.44 
 
 
473 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.411369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3753  amino acid permease-associated region  43.59 
 
 
478 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2021  amino acid permease-associated region  45.27 
 
 
480 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0906  amino acid permease-associated region  43.78 
 
 
468 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0122  amino acid permease-associated region  48.02 
 
 
606 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1998  amino acid permease-associated region  45.92 
 
 
608 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.89102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3433  amino acid permease-associated region  45.92 
 
 
606 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2002  amino acid transporter  46.43 
 
 
473 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3371  amino acid permease-associated region  45.92 
 
 
606 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3382  amino acid permease-associated region  45.92 
 
 
606 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10533  gaba permease gabP (4-amino butyrate transport carrier)  45.26 
 
 
434 aa  343  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0448  amino acid permease-associated region  42.03 
 
 
456 aa  335  7.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.807242  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2188  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 
491 aa  335  9e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000662916  hitchhiker  0.000260404 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3325  amino acid permease-associated region  43.71 
 
 
471 aa  335  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22390  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  41.16 
 
 
457 aa  334  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2616  amino acid permease-associated region  41.34 
 
 
464 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923502  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6620  amino acid permease-associated region  44.42 
 
 
484 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.693405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  39.1 
 
 
460 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  39.1 
 
 
460 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  39.1 
 
 
460 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3002  amino acid permease-associated region  41.27 
 
 
455 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.993611  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0786  amino acid tranporter  39.18 
 
 
459 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  37.67 
 
 
461 aa  316  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  37.44 
 
 
485 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  37.44 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4907  amino acid permease-associated region  38.95 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>