176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1181 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1181  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 469 aa  905    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0719  amino acid permease family protein  44.82 
 
 		 469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.544014  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0867  amino acid permease-associated region  44.82 
 
 		 469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0935  amino acid permease-associated region  40.89 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 506 aa  86.7  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  25.14 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  21.27 
 
 		 456 aa  67  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  20.72 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 516 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  27.18 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 518 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 473 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  24.92 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  24.92 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.69 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.85 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.85 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.69 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  24.29 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.92 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  24.92 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4411  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528194  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 509 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  24.22 
 
 		 474 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  26.79 
 
 		 460 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  23.57 
 
 		 465 aa  54.3  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 482 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 496 aa  53.9  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 466 aa  53.9  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1373  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 478 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 483 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 510 aa  53.5  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  26.92 
 
 		 535 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 513 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  26.16 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 535 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 		 468 aa  50.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  23.43 
 
 		 496 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.5 
 
 		 460 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  23.93 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  25.47 
 
 		 418 aa  50.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  22.91 
 
 		 476 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 502 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  24.93 
 
 		 553 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  22.74 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 510 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  28.06 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  21.75 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 511 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  23.93 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  24.92 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  23.05 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  24.5 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  23.53 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  23.51 
 
 		 543 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  22.58 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  24.49 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 466 aa  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 491 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  35.11 
 
 		 416 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  35.11 
 
 		 416 aa  47  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 494 aa  47  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  35.11 
 
 		 416 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  21.47 
 
 		 476 aa  47  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  21.47 
 
 		 476 aa  47  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>