More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5375 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  100 
 
 
483 aa  923    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  83.58 
 
 
483 aa  727    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  100 
 
 
483 aa  923    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  98.97 
 
 
487 aa  854    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  84.47 
 
 
483 aa  729    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  60.12 
 
 
505 aa  534  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  55.35 
 
 
486 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  55.35 
 
 
486 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  55.35 
 
 
486 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  43.55 
 
 
497 aa  349  8e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  35.13 
 
 
494 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  33.78 
 
 
505 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  33.96 
 
 
506 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  35.74 
 
 
496 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 
504 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  31.39 
 
 
547 aa  178  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 
521 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  32.89 
 
 
513 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 
521 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 
521 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  30.55 
 
 
503 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 
506 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 
538 aa  153  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  32.57 
 
 
531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 
562 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  30.31 
 
 
549 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  29.49 
 
 
519 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 
502 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 
510 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  26.17 
 
 
527 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 
514 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 
496 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 
492 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  26.96 
 
 
521 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 
527 aa  99.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 
522 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 
510 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  26.33 
 
 
510 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 
530 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 
516 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 
539 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 
514 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 
499 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  23.33 
 
 
514 aa  91.3  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  24.85 
 
 
571 aa  91.7  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 
499 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 
486 aa  90.1  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 
482 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 
482 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  26.9 
 
 
483 aa  86.7  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  25.06 
 
 
519 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.65 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  25.06 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.32 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.32 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.32 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  27.87 
 
 
467 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 
466 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.54 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 
466 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  27.32 
 
 
467 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.93 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.93 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.93 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.93 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  28.02 
 
 
460 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.93 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.54 
 
 
471 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 
449 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 
515 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.27 
 
 
467 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.62 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.27 
 
 
467 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.27 
 
 
467 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  27.27 
 
 
467 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.76 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.27 
 
 
467 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 
466 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  24.43 
 
 
539 aa  80.9  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.27 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  23.29 
 
 
537 aa  80.9  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  27.18 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 
503 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  27.18 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  27.18 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  27.18 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  27.18 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  27.18 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  27.18 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  25.08 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>