More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3628 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 451 aa  889    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 479 aa  126  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2950  amino acid permease-associated region  33.04 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0619  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  28.5 
 
 		 477 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  27 
 
 		 471 aa  99.8  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3512  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 498 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  normal  0.430262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  28.24 
 
 		 477 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  29.38 
 
 		 413 aa  97.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.03 
 
 		 422 aa  97.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 725 aa  96.3  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 494 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 494 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 500 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 500 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 500 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  27.68 
 
 		 500 aa  93.2  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  27.53 
 
 		 496 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  26.75 
 
 		 467 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  27.53 
 
 		 496 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 479 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  26.09 
 
 		 499 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  26.09 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  26.09 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  26.09 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  26.77 
 
 		 496 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0945  amino acid permease  26.77 
 
 		 496 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  26.09 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0346  amino acid permease  26.77 
 
 		 496 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362616  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  26.77 
 
 		 496 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  26.57 
 
 		 496 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 499 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 716 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  26.1 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 480 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 483 aa  87  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  25.43 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  27.9 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  27.91 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  25.66 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  27.02 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.22 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  26.36 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  26.48 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  24.75 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  23.81 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  27.48 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  26.56 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  26.56 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.42 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11210  putative amino acid permease  28.41 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.878559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  26.53 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 		 641 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  26.5 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 		 773 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  26.17 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  27.34 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  26.39 
 
 		 753 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  26.91 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.26 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1020  amino acid permease  27.56 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3189  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 		 482 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 740 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  25.61 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1029  amino acid permease  28.08 
 
 		 497 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2325  amino acid permease  27.53 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 764 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  22.58 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  22.83 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4398  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  24.32 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>