More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1203 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0945  amino acid permease  99.6 
 
 		 496 aa  976    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0619  amino acid permease-associated region  69.08 
 
 		 497 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  99.36 
 
 		 467 aa  920    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  100 
 
 		 496 aa  981    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0346  amino acid permease  99.6 
 
 		 496 aa  976    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362616  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  99.6 
 
 		 496 aa  977    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  88.71 
 
 		 494 aa  859    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  99.6 
 
 		 496 aa  976    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  87.75 
 
 		 500 aa  868    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  92.14 
 
 		 496 aa  894    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  99.19 
 
 		 496 aa  973    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  87.78 
 
 		 500 aa  864    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  88.71 
 
 		 494 aa  859    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  86.55 
 
 		 500 aa  855    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  86.75 
 
 		 500 aa  860    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  87.12 
 
 		 499 aa  838    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3512  amino acid permease-associated region  67.8 
 
 		 498 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  normal  0.430262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  63.46 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  63.46 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1029  amino acid permease  68.66 
 
 		 497 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  63.46 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  63.46 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  63.25 
 
 		 499 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11210  putative amino acid permease  68.87 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.878559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  32.69 
 
 		 479 aa  226  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  33.12 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 		 459 aa  171  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  32.9 
 
 		 477 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 464 aa  158  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 436 aa  97.8  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 517 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  24.93 
 
 		 467 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  29.4 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  28.72 
 
 		 458 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  28.57 
 
 		 457 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.02 
 
 		 471 aa  87  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  30.57 
 
 		 501 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  28.46 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  26.77 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  26.14 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.73 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  27.53 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  25.79 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 773 aa  81.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  25.65 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  25.19 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  25.59 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 521 aa  80.1  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  26.46 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26.29 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  31.71 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  31.71 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1676  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26.29 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  25.93 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  25 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  25.44 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  26.91 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  26.23 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  25.65 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  30.74 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  30.71 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  25.13 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  25.13 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  25.13 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  25.26 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  26.6 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  25.26 
 
 		 469 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  25.26 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  25.26 
 
 		 469 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  25.26 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  25.65 
 
 		 467 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  25.26 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>