More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0458 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 464 aa  929    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  68.55 
 
 		 459 aa  620  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  49.55 
 
 		 479 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  43.01 
 
 		 477 aa  329  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  43.01 
 
 		 477 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  30.38 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  30.38 
 
 		 500 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  30.38 
 
 		 494 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  30.38 
 
 		 494 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  30.54 
 
 		 500 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  30.54 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  29.72 
 
 		 499 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  29.51 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  29.51 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  29.51 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  29.51 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  29.2 
 
 		 496 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0619  amino acid permease-associated region  30.69 
 
 		 497 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3512  amino acid permease-associated region  30.75 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  normal  0.430262 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  29.94 
 
 		 496 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  30.24 
 
 		 467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0945  amino acid permease  29.94 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  29.94 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0346  amino acid permease  29.94 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362616  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  29.72 
 
 		 496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  30.24 
 
 		 496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1029  amino acid permease  31.58 
 
 		 497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11210  putative amino acid permease  31.89 
 
 		 496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.878559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 494 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2943  gamma-aminobutyrate transporter  28.69 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1020  GABA permease  27.92 
 
 		 466 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3218  gamma-aminobutyrate transporter  27.92 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2798  gamma-aminobutyrate transporter  27.92 
 
 		 466 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1043  gamma-aminobutyrate transporter  27.92 
 
 		 466 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2783  gamma-aminobutyrate transporter  27.92 
 
 		 466 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.414998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02519  gamma-aminobutyrate transporter  27.92 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3905  gamma-aminobutyrate transporter  27.92 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.667666 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 506 aa  87.8  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02483  hypothetical protein  27.92 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  28.53 
 
 		 441 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 499 aa  87.4  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3095  gamma-aminobutyrate transporter  28.14 
 
 		 466 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2973  gamma-aminobutyrate transporter  28.14 
 
 		 466 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  0.0482196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2990  gamma-aminobutyrate transporter  28.14 
 
 		 466 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2906  gamma-aminobutyrate transporter  28.14 
 
 		 466 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2938  gamma-aminobutyrate transporter  27.84 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.111546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  25.98 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  24.28 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.26 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  24.73 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  24.73 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  24.82 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  25.24 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.66 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  25.97 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  24.73 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  24.73 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  24.73 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  24.73 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  27.66 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.84 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  26.43 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0870  putative proline-specific permease  23.81 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  26.41 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  24.17 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  24.17 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  24.17 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 486 aa  73.2  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  24.17 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  24.75 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  24 
 
 		 452 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  25.56 
 
 		 470 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0905  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00350  predicted cryptic proline transporter  24.1 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3207  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.168679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  26.41 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0433  putative proline-specific permease  24.1 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0321  putative proline-specific permease  24.1 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.498957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0432  putative proline-specific permease  24.1 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.91 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0834  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  26.41 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0472  putative proline-specific permease  24.1 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3231  putative proline-specific permease  24.1 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000934301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0479  putative proline-specific permease  24.1 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.339066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00354  hypothetical protein  24.1 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  26.05 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  26.05 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  26.83 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  26.05 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  26.05 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>