More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1837 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 459 aa  918    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  68.55 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  51.54 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  43.11 
 
 		 477 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  43.11 
 
 		 477 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  30.24 
 
 		 500 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  30.28 
 
 		 500 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  30.32 
 
 		 500 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 500 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  30.82 
 
 		 499 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  29.59 
 
 		 499 aa  177  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  30.39 
 
 		 499 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  30.39 
 
 		 499 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  30.39 
 
 		 499 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  30.39 
 
 		 499 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0619  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 497 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  29.72 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  29.93 
 
 		 467 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  29.93 
 
 		 496 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  28.98 
 
 		 496 aa  170  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0945  amino acid permease  29.93 
 
 		 496 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0346  amino acid permease  29.93 
 
 		 496 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362616  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  29.93 
 
 		 496 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  29.5 
 
 		 496 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3512  amino acid permease-associated region  30.84 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  normal  0.430262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1029  amino acid permease  29.44 
 
 		 497 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11210  putative amino acid permease  29.18 
 
 		 496 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.878559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 436 aa  103  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  30.99 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 439 aa  90.5  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 455 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  23.63 
 
 		 636 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  23.63 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.63 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  23.54 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  22.4 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  24.86 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  25.44 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  25.13 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.4 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1013  putative proline-specific permease  24.34 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 490 aa  76.6  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  22.76 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  23.21 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  23.21 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  23.3 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  23.21 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  26 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  26 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  26 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  26 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  23.38 
 
 		 725 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.65 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  24.7 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  26 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  24.25 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3101  putative proline-specific permease  23.27 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  23.38 
 
 		 641 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  24.6 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  22 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2910  putative proline-specific permease  22.43 
 
 		 459 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  26.18 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  22.2 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  27.43 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 546 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  27.91 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  22.2 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  24.61 
 
 		 480 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  22.2 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0870  putative proline-specific permease  23.14 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  22.17 
 
 		 716 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  22.2 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.92 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3218  gamma-aminobutyrate transporter  24.22 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  24.47 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  28.01 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  28.01 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  22.51 
 
 		 520 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>