More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3822 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  90.13 
 
 
496 aa  832    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0346  amino acid permease  87.53 
 
 
496 aa  841    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362616  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  90.13 
 
 
467 aa  831    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  94.79 
 
 
500 aa  932    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  87.32 
 
 
496 aa  842    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  87.32 
 
 
496 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  93.79 
 
 
500 aa  926    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  88.33 
 
 
496 aa  856    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  94.19 
 
 
500 aa  915    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  87.53 
 
 
496 aa  841    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3512  amino acid permease-associated region  68.71 
 
 
498 aa  649    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  normal  0.430262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  94.73 
 
 
494 aa  920    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  93.99 
 
 
500 aa  912    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0619  amino acid permease-associated region  71.34 
 
 
497 aa  662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  100 
 
 
499 aa  984    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  94.73 
 
 
494 aa  920    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0945  amino acid permease  87.53 
 
 
496 aa  841    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  63.46 
 
 
499 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  63.46 
 
 
499 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  63.46 
 
 
499 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1029  amino acid permease  68.44 
 
 
497 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  63.46 
 
 
499 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  63.46 
 
 
499 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11210  putative amino acid permease  69.3 
 
 
496 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.878559  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  31.05 
 
 
479 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  33.92 
 
 
477 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  33.7 
 
 
477 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  28.46 
 
 
458 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  25.73 
 
 
467 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 
436 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  29.38 
 
 
457 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 
451 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  28.2 
 
 
458 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  28.61 
 
 
456 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 
492 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  25.8 
 
 
469 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.74 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 
773 aa  83.6  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 
517 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 
466 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  30.94 
 
 
455 aa  82.8  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 
443 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 
490 aa  82  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 
496 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  26.75 
 
 
522 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  27.72 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  26.92 
 
 
473 aa  80.9  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 
501 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  25.9 
 
 
470 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  27.64 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.04 
 
 
500 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 
481 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  26.38 
 
 
636 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  25.64 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  26.6 
 
 
470 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 
481 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  25.46 
 
 
470 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  25.9 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  25.9 
 
 
470 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  25.05 
 
 
477 aa  77.8  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  25.88 
 
 
480 aa  77.8  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  25.96 
 
 
461 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 
486 aa  77.4  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 
506 aa  76.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  24.71 
 
 
437 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  24.48 
 
 
438 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 
495 aa  76.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  24.94 
 
 
437 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 
482 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  24.42 
 
 
438 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  24.71 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  24.42 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  24.42 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  24.71 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  25.8 
 
 
525 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 
518 aa  75.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  31.75 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  31.75 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  25.9 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  24.57 
 
 
467 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  24.57 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  25.38 
 
 
470 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  25.38 
 
 
470 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  25.51 
 
 
470 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  25.41 
 
 
485 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  24.74 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 
515 aa  73.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  24.93 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 
502 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 
521 aa  73.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>