More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4773 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  69.43 
 
 
463 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  71.74 
 
 
470 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  73.5 
 
 
469 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  71.11 
 
 
467 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  73.5 
 
 
469 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  73.5 
 
 
469 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  73.5 
 
 
469 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  71.55 
 
 
470 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  72.06 
 
 
470 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  72.28 
 
 
470 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  70.19 
 
 
467 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  73.72 
 
 
469 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  73.72 
 
 
469 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  72.28 
 
 
470 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  71.83 
 
 
461 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  70.73 
 
 
474 aa  638    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  74.77 
 
 
469 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  78.02 
 
 
463 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  70.89 
 
 
467 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  78.19 
 
 
470 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  100 
 
 
469 aa  922    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  67.31 
 
 
477 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  77.4 
 
 
473 aa  689    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  72.06 
 
 
470 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  72.73 
 
 
470 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  73.5 
 
 
469 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  70.67 
 
 
456 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  70.13 
 
 
454 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  70.8 
 
 
457 aa  616  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  70.35 
 
 
454 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  68.81 
 
 
456 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  70.6 
 
 
454 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  69.45 
 
 
467 aa  616  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  70.16 
 
 
455 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  69.04 
 
 
455 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  67.68 
 
 
458 aa  608  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  68.82 
 
 
455 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  67.48 
 
 
458 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  68.14 
 
 
453 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  51.92 
 
 
445 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  50 
 
 
441 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  47.35 
 
 
445 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  43.1 
 
 
495 aa  323  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  42.86 
 
 
467 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  39.72 
 
 
482 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  40.24 
 
 
482 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  39.95 
 
 
482 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  40.76 
 
 
482 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  38.29 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  36.99 
 
 
483 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  38.29 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  38.29 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  39.96 
 
 
485 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  40.52 
 
 
482 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  40.52 
 
 
482 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  37.67 
 
 
479 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  36.84 
 
 
479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  42.49 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  37.25 
 
 
486 aa  233  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  39.75 
 
 
480 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  37.92 
 
 
479 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  37.2 
 
 
486 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  34.6 
 
 
499 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  39.21 
 
 
471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  40.28 
 
 
469 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  34.17 
 
 
467 aa  217  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  35.27 
 
 
505 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  40.67 
 
 
490 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  35.83 
 
 
497 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  34.47 
 
 
500 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  36.39 
 
 
463 aa  211  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  31.09 
 
 
509 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  31.09 
 
 
509 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  31.09 
 
 
509 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  34.84 
 
 
468 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  28.29 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  28.23 
 
 
467 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  30.82 
 
 
483 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  35.2 
 
 
443 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 
465 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 
474 aa  133  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 
483 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.93 
 
 
422 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  29.36 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  28.95 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 
462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 
462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 
462 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.6 
 
 
489 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  26.82 
 
 
467 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 
455 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 
476 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  26.5 
 
 
479 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 
476 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 
506 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 
491 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 
521 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  26.71 
 
 
467 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  25.58 
 
 
512 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.250254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>