More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4445 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  86.6 
 
 
470 aa  818    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  89.33 
 
 
469 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  93.79 
 
 
467 aa  882    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  79.48 
 
 
463 aa  727    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  79.37 
 
 
455 aa  691    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  86.97 
 
 
461 aa  816    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  89.33 
 
 
469 aa  809    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  89.11 
 
 
469 aa  806    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  70.2 
 
 
470 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  78.06 
 
 
477 aa  738    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  85.96 
 
 
470 aa  809    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  89.11 
 
 
469 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  74 
 
 
456 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  86.17 
 
 
470 aa  813    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  89.33 
 
 
469 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  89.33 
 
 
469 aa  809    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  71.27 
 
 
474 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  87.02 
 
 
470 aa  820    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  88.89 
 
 
469 aa  780    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  79.08 
 
 
467 aa  707    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  100 
 
 
467 aa  933    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  71.27 
 
 
470 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  88.89 
 
 
469 aa  804    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  86.6 
 
 
470 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  98.07 
 
 
467 aa  918    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  85.53 
 
 
470 aa  807    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  70.89 
 
 
454 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  71.24 
 
 
454 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  69.66 
 
 
458 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  69.44 
 
 
456 aa  628  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  69.27 
 
 
457 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  70.89 
 
 
469 aa  626  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  69.44 
 
 
458 aa  627  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  70.67 
 
 
454 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  70.31 
 
 
463 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  68.96 
 
 
473 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  68.15 
 
 
455 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  67.93 
 
 
455 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  70.98 
 
 
453 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  51.94 
 
 
445 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  47.63 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  47.52 
 
 
445 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  39.96 
 
 
495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  39.83 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  36.62 
 
 
483 aa  256  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  37.97 
 
 
467 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  37.97 
 
 
467 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  37.97 
 
 
467 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  36.88 
 
 
480 aa  246  8e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  38.44 
 
 
482 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  37.69 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  37.58 
 
 
479 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  37.83 
 
 
482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  38.7 
 
 
482 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  38.7 
 
 
482 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  38.7 
 
 
482 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  36.11 
 
 
479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  34.39 
 
 
500 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  35.64 
 
 
467 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  37.34 
 
 
479 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  33.84 
 
 
499 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  36.47 
 
 
485 aa  229  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  33.68 
 
 
486 aa  229  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  39.08 
 
 
488 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  35.13 
 
 
463 aa  227  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  37.66 
 
 
469 aa  223  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  35.65 
 
 
471 aa  220  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  34.51 
 
 
486 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  34.28 
 
 
505 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  35.28 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  38.21 
 
 
490 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  33.84 
 
 
497 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  31.7 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  31.7 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  31.7 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  29.69 
 
 
456 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  28.57 
 
 
467 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 
483 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  30.05 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 
443 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.01 
 
 
460 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  32.55 
 
 
495 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 
466 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 
468 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 
468 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 
468 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 
520 aa  120  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 
466 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.75 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.5 
 
 
422 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
466 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 
486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.9 
 
 
468 aa  117  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 
481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.69 
 
 
485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.56 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  29.34 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>