More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3470 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  99.6 
 
 		 499 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0619  amino acid permease-associated region  70.42 
 
 		 497 aa  714    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  99.6 
 
 		 499 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3512  amino acid permease-associated region  63.75 
 
 		 498 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  normal  0.430262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  99.6 
 
 		 499 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  100 
 
 		 499 aa  1003    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  99.6 
 
 		 499 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  62.98 
 
 		 500 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  63.25 
 
 		 500 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  63.46 
 
 		 499 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  62.98 
 
 		 494 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  62.98 
 
 		 494 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  63.25 
 
 		 500 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  62.98 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  63.25 
 
 		 496 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  63.03 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  63.03 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0346  amino acid permease  63.03 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1029  amino acid permease  65.64 
 
 		 497 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0945  amino acid permease  63.03 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  63.28 
 
 		 467 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  63.28 
 
 		 496 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  62.82 
 
 		 496 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11210  putative amino acid permease  65.03 
 
 		 496 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.878559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  30.19 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  30.82 
 
 		 459 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  32.29 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  32.08 
 
 		 477 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  26.92 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 451 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  27 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  27.1 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  28.34 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  32.72 
 
 		 517 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 716 aa  87  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  28.77 
 
 		 470 aa  86.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  31.33 
 
 		 495 aa  86.7  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  28.54 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  28.54 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  28.05 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  28.54 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  26.67 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  28.54 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  31.2 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  27.8 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  26 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  26 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  26 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  26 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  27.4 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  26.17 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  26.99 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  25.18 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  24.93 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  27.49 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  27.39 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  27.16 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  25.3 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  27.54 
 
 		 469 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  25.3 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  27.54 
 
 		 469 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  27.54 
 
 		 469 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  25.3 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  27.54 
 
 		 469 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  28.22 
 
 		 469 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  26.24 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  31.17 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  26.24 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  25.3 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  26 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  27.29 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  22.65 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  26 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  26.52 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.46 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  24.24 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 		 773 aa  77.8  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  27.29 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  27.29 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  27.78 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  27.2 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  31.23 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>