More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2927 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  80.41 
 
 
455 aa  704    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  89.78 
 
 
467 aa  812    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  92.34 
 
 
469 aa  845    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  92.34 
 
 
469 aa  845    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  92.13 
 
 
469 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  72.61 
 
 
454 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  92.13 
 
 
469 aa  843    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  74.16 
 
 
456 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  97.66 
 
 
470 aa  907    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  69.96 
 
 
470 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  87.02 
 
 
467 aa  823    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  71.15 
 
 
474 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  95.86 
 
 
461 aa  871    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  91.91 
 
 
469 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  92.13 
 
 
469 aa  819    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  80.77 
 
 
463 aa  722    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  78.46 
 
 
467 aa  701    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  86.6 
 
 
467 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  72.25 
 
 
470 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  92.34 
 
 
469 aa  845    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  100 
 
 
470 aa  927    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  99.36 
 
 
470 aa  924    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  76.89 
 
 
477 aa  695    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  95.96 
 
 
470 aa  896    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  96.38 
 
 
470 aa  899    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  92.34 
 
 
469 aa  845    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  100 
 
 
470 aa  927    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  72.06 
 
 
469 aa  634  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  71.84 
 
 
463 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  69.51 
 
 
456 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  68.82 
 
 
458 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  71.49 
 
 
454 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  71.71 
 
 
454 aa  624  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  70.56 
 
 
457 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  68.4 
 
 
473 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  69.3 
 
 
458 aa  618  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  67.41 
 
 
455 aa  595  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  68.08 
 
 
455 aa  597  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  70.39 
 
 
453 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  53.7 
 
 
445 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  46.1 
 
 
441 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  47.77 
 
 
445 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  42.66 
 
 
495 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  41.5 
 
 
467 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  38.77 
 
 
482 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  40.72 
 
 
482 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  36.52 
 
 
483 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  40.45 
 
 
482 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  40.21 
 
 
482 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  40.2 
 
 
482 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  40.2 
 
 
482 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  37.83 
 
 
467 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  37.83 
 
 
467 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  37.83 
 
 
467 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  36.97 
 
 
480 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  37.8 
 
 
485 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  36.98 
 
 
479 aa  226  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  33.84 
 
 
500 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  34.84 
 
 
499 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  40.86 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  35.9 
 
 
479 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  34.9 
 
 
467 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  36.48 
 
 
505 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  36.45 
 
 
463 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  33.55 
 
 
486 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  36.93 
 
 
471 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  34.58 
 
 
486 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  38.5 
 
 
469 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  35.56 
 
 
479 aa  206  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  36.62 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  37.89 
 
 
490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  32.98 
 
 
497 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  29.89 
 
 
456 aa  172  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  29.67 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 
483 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  29.04 
 
 
474 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  28.9 
 
 
483 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  35.41 
 
 
443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.98 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.98 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.27 
 
 
471 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  28.44 
 
 
485 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.07 
 
 
471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  34.09 
 
 
495 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  28.41 
 
 
792 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29.26 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  25.93 
 
 
460 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  28.06 
 
 
467 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  28.06 
 
 
467 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  28.06 
 
 
467 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  28.23 
 
 
467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  28.23 
 
 
467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  28.23 
 
 
467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  28.23 
 
 
467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 
466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  28.3 
 
 
467 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>