More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0346 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0346  amino acid permease  100 
 
 		 496 aa  979    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  88.5 
 
 		 494 aa  855    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  99.79 
 
 		 467 aa  924    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  99.6 
 
 		 496 aa  975    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  87.32 
 
 		 499 aa  838    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  99.6 
 
 		 496 aa  976    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  99.6 
 
 		 496 aa  976    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0619  amino acid permease-associated region  69.08 
 
 		 497 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  87.55 
 
 		 500 aa  864    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  100 
 
 		 496 aa  979    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  92.54 
 
 		 496 aa  899    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  88.5 
 
 		 494 aa  855    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0945  amino acid permease  100 
 
 		 496 aa  979    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  87.58 
 
 		 500 aa  860    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  86.55 
 
 		 500 aa  857    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  86.35 
 
 		 500 aa  853    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3512  amino acid permease-associated region  67.59 
 
 		 498 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  normal  0.430262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  63.25 
 
 		 499 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  63.25 
 
 		 499 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1029  amino acid permease  68.66 
 
 		 497 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  63.25 
 
 		 499 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  63.25 
 
 		 499 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  63.03 
 
 		 499 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11210  putative amino acid permease  68.87 
 
 		 496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.878559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  32.18 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  33.33 
 
 		 477 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  33.12 
 
 		 477 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 464 aa  157  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 436 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  24.93 
 
 		 467 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  27.02 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 517 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  29.4 
 
 		 456 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  28.72 
 
 		 458 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.34 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  28.3 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  28.46 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  27.02 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  26.77 
 
 		 463 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  26.14 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  26.46 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 		 773 aa  81.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26.29 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26.29 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.13 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  26.23 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  25.79 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  25.65 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  31.71 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  28.47 
 
 		 503 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  25.19 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  24.76 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  31.71 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1676  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047453  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  25.59 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  27.81 
 
 		 636 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  26.36 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 515 aa  76.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3413  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 513 aa  76.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  31.22 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.25 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  31.22 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  26.78 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  25.13 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  31.03 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 518 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  25.13 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  25.65 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  25.13 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  25.26 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  25.39 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>