More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3413 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3413  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 513 aa  1000    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0506  amino acid permease-associated region  41.11 
 
 		 460 aa  306  6e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  33.23 
 
 		 716 aa  146  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  32.55 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 462 aa  130  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  31.49 
 
 		 753 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  30.46 
 
 		 764 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.78 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 786 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  31.9 
 
 		 740 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  27.54 
 
 		 476 aa  123  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  27.54 
 
 		 476 aa  123  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 475 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 476 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  28.28 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  28.28 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 		 770 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 486 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  31.69 
 
 		 518 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  29.59 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  29.59 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  29.59 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.61 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  29.36 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  29.36 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  29.36 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  29.36 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.85 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 474 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.85 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.7 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.85 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 506 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.59 
 
 		 489 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  29.36 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.85 
 
 		 467 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.6 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  28.49 
 
 		 820 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.81 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  28.53 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  28.36 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.44 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.57 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  29.12 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.57 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 		 725 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 792 aa  107  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  30.21 
 
 		 773 aa  106  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 488 aa  106  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 506 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  27.03 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  30.15 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  28.66 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.76 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.76 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.76 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.76 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.76 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.76 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  27.03 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.76 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  27.03 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  27.03 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 481 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 		 495 aa  103  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 490 aa  103  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.72 
 
 		 471 aa  103  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  25.83 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  25.83 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  28.86 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  30.69 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  26.65 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  27.55 
 
 		 500 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 486 aa  100  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 476 aa  100  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 465 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>