More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3285 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  100 
 
 		 522 aa  1045    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  50.3 
 
 		 490 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  47.85 
 
 		 499 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  48.17 
 
 		 469 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  48.12 
 
 		 474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  44.31 
 
 		 473 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  49.3 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  34.3 
 
 		 489 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  34.49 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  31.86 
 
 		 485 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  33.53 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  31.2 
 
 		 439 aa  236  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  35.71 
 
 		 495 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  31.08 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  29.88 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  30.2 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  29.01 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  28.89 
 
 		 443 aa  177  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 467 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  29.67 
 
 		 437 aa  170  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  29.67 
 
 		 438 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  29.67 
 
 		 438 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  29.67 
 
 		 437 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  28.25 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  29.47 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  29.47 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  29.47 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  29.47 
 
 		 438 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  29.86 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  26.21 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 447 aa  154  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  26.2 
 
 		 609 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  26.02 
 
 		 580 aa  151  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  26.04 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 448 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 444 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  28.77 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  24.69 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  25 
 
 		 503 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 494 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.59 
 
 		 471 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.59 
 
 		 471 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  25.39 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.39 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  31.89 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 476 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 539 aa  114  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.76 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  23.41 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 486 aa  110  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.57 
 
 		 463 aa  110  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  26.14 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 476 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  24.35 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  23.3 
 
 		 489 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  23 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  23 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 770 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  22.78 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  23.2 
 
 		 445 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  23.2 
 
 		 445 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  23.2 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  23.2 
 
 		 445 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  24.78 
 
 		 480 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  23.48 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 494 aa  104  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  24.57 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  23.48 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 541 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 764 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  23.2 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 500 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 495 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  24.91 
 
 		 495 aa  103  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 541 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 481 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  26.64 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  25.62 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  25.05 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>