More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1526 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  100 
 
 
440 aa  863    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  100 
 
 
440 aa  863    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  50.23 
 
 
452 aa  384  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  42.4 
 
 
443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  41.88 
 
 
437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  40.91 
 
 
437 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  40.5 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  40.91 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  40.87 
 
 
438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  40.87 
 
 
438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  40.27 
 
 
438 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  40.27 
 
 
438 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  40.27 
 
 
438 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  41.19 
 
 
435 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  38.99 
 
 
453 aa  293  4e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  36.1 
 
 
443 aa  264  3e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  40.84 
 
 
387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  37.16 
 
 
442 aa  249  7e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  30.97 
 
 
485 aa  223  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 
469 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  32.07 
 
 
473 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 
461 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  29.43 
 
 
452 aa  193  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 
499 aa  192  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 
474 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  29.75 
 
 
490 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  29.51 
 
 
489 aa  187  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 
473 aa  183  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  31.06 
 
 
439 aa  183  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  28.89 
 
 
522 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  27.87 
 
 
445 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 
467 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 
447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  28.4 
 
 
458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 
447 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 
472 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  24.84 
 
 
609 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  26.87 
 
 
580 aa  150  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 
495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 
452 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  28.06 
 
 
443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  27.94 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 
484 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  26.46 
 
 
462 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  26.58 
 
 
445 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  26.46 
 
 
462 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  26.46 
 
 
445 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 
445 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  26.46 
 
 
445 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  30.52 
 
 
449 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  26.46 
 
 
445 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  25.78 
 
 
462 aa  136  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  31.58 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 
448 aa  133  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 
786 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 
441 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 
427 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 
454 aa  120  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  25.05 
 
 
507 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 
494 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  30.3 
 
 
470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  25.32 
 
 
543 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 
439 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 
445 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 
716 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01631  methionine transporter (Eurofung)  26.39 
 
 
540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.281549  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 
770 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 
530 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  28.82 
 
 
446 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.53 
 
 
471 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.53 
 
 
471 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.53 
 
 
471 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.53 
 
 
471 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.53 
 
 
471 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.31 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  26.12 
 
 
528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 
543 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.31 
 
 
471 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 
471 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.59 
 
 
471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 
546 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 
544 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 
576 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 
452 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 
471 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  27.97 
 
 
471 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 
635 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  27.97 
 
 
471 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  27.97 
 
 
471 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 
532 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  25.24 
 
 
518 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 
436 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 
725 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 
555 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>