More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1589 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  100 
 
 
450 aa  893    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  36.94 
 
 
443 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  29 
 
 
452 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  29.02 
 
 
443 aa  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 
453 aa  143  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 
443 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 
442 aa  120  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 
440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 
440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 
437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  27.06 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  27.06 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 
435 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  29.18 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  29.18 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  29.18 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  29.18 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  28.88 
 
 
437 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  29.18 
 
 
438 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  29.1 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  28.96 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  24.8 
 
 
522 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  23.6 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  24.13 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  24.64 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 
469 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  22.95 
 
 
485 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  24.55 
 
 
439 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  25.82 
 
 
440 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  25 
 
 
445 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  25 
 
 
445 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  25 
 
 
462 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  25 
 
 
462 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  25 
 
 
445 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  22.1 
 
 
499 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 
463 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  25 
 
 
445 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  25 
 
 
445 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  26.06 
 
 
753 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  25 
 
 
462 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  25.95 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 
441 aa  60.5  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 
473 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 
463 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  23.56 
 
 
430 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  23.85 
 
 
460 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  23.71 
 
 
445 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  22.32 
 
 
445 aa  57.4  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  23.64 
 
 
471 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 
740 aa  57  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0867  amino acid transporter  22.5 
 
 
450 aa  56.6  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00919336  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 
430 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 
430 aa  56.6  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  23.33 
 
 
430 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 
430 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl605  putative amino acid/amine (lysine) APC transporter  23.74 
 
 
462 aa  56.2  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 
473 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  23.33 
 
 
471 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  23.11 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  22.02 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  21.19 
 
 
476 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  22.02 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  22.85 
 
 
422 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  23.11 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  22.02 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  22.02 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  22.02 
 
 
445 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 
786 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  21.19 
 
 
476 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  23.11 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  22.68 
 
 
433 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  22.02 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  21.19 
 
 
476 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  22.02 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  21.19 
 
 
476 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  22.02 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  22.32 
 
 
445 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  22.32 
 
 
445 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  22.32 
 
 
445 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  22.32 
 
 
445 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  22.33 
 
 
473 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  24.01 
 
 
447 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  24.01 
 
 
447 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  22.33 
 
 
473 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  22.33 
 
 
473 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 
490 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  24.01 
 
 
447 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  22.33 
 
 
473 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  24.68 
 
 
441 aa  54.3  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  26.42 
 
 
543 aa  54.3  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  22.33 
 
 
473 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  23.63 
 
 
470 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  24.01 
 
 
485 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 
472 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  25 
 
 
476 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>