More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0924 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 449 aa  897    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  67.33 
 
 		 452 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  32.89 
 
 		 450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  27.39 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 437 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26.67 
 
 		 437 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  26.44 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26.95 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  26.44 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  26.44 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26.44 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  26.44 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  26.44 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  29.28 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  27.99 
 
 		 440 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  29.45 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  24.13 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  22.97 
 
 		 580 aa  82  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  28.11 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  24.48 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  24.78 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  25.82 
 
 		 543 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  24.18 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl605  putative amino acid/amine (lysine) APC transporter  21.49 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  25.07 
 
 		 541 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 541 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 541 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 541 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  27.8 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 541 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  25.29 
 
 		 541 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  24.74 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  25.75 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 532 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  25.34 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  25.29 
 
 		 664 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  24.44 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 555 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  25.29 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  24.48 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf753  amino acid permease  25.94 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  24.48 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  24.48 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  24.48 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  24.48 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  24.48 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  24.48 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  25 
 
 		 666 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  24.41 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  22.75 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  24.63 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 521 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19660  amino acid transporter  26.9 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.598137  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  23.2 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  24.63 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  23.03 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  24.63 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  24.05 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 529 aa  67.4  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 		 463 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  26.3 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2800  lysine/cadaverine antiporter  26.3 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.1623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  26.3 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  24.91 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  23.15 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  26.3 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2821  lysine/cadaverine antiporter  26.3 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  24.17 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  22.74 
 
 		 576 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  27.35 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>