More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5443 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 463 aa  923    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  55.86 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  36.84 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  31.97 
 
 		 485 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  30.29 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 461 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  31.19 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 490 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  30.38 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  30.41 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 447 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  30.12 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  27.74 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  28.47 
 
 		 445 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  30.97 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  27.91 
 
 		 443 aa  152  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  32.85 
 
 		 495 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  29.49 
 
 		 463 aa  150  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  29.43 
 
 		 440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 435 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 		 499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 437 aa  140  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 438 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 438 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 437 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  26.92 
 
 		 452 aa  139  7e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  25.73 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  25.73 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  25.73 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.73 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  27.39 
 
 		 522 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 473 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  29.78 
 
 		 580 aa  133  7.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 		 770 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 		 448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 440 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 440 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  26.82 
 
 		 609 aa  126  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 786 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  30.92 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 764 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  25.58 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  25.58 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  25.58 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  25.59 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  25.58 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 		 740 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  29.25 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  25.58 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  25.32 
 
 		 462 aa  114  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 641 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 439 aa  113  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  25.45 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 773 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 488 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 		 473 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  28.45 
 
 		 474 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 		 454 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 745 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.41 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  24.7 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.5 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.5 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.5 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.5 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.5 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.5 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.5 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 820 aa  100  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  25.07 
 
 		 445 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  29.71 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  24.46 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  25.07 
 
 		 445 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  25.07 
 
 		 445 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  25.07 
 
 		 445 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  29.43 
 
 		 464 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  25.53 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  29.4 
 
 		 457 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 445 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  25.07 
 
 		 445 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>