More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0176 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 447 aa  886    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  48.43 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  48.61 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  44 
 
 		 463 aa  340  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  41.27 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  31.69 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2830  amino acid permease family protein  37.44 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  30.82 
 
 		 485 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  28.25 
 
 		 522 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 499 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  31 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 474 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  30.74 
 
 		 472 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  32.31 
 
 		 473 aa  172  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 452 aa  169  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  29.34 
 
 		 440 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  28.7 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  25.85 
 
 		 489 aa  162  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  28.77 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  30.6 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  29.04 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  28.1 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 437 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  27.99 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  27.8 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  27.8 
 
 		 437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  24.67 
 
 		 580 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  27.8 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  27.8 
 
 		 437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  27.77 
 
 		 438 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  27.77 
 
 		 438 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  27.77 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  26.88 
 
 		 443 aa  130  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  24.52 
 
 		 609 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  26.67 
 
 		 480 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  26.94 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  24.62 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  25.26 
 
 		 462 aa  96.3  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09300  amino acid transporter (Eurofung)  25.83 
 
 		 614 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917977  normal  0.922161 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28954  very low affinity methionine permease  25.33 
 
 		 550 aa  95.9  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144807  normal  0.597745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  26.29 
 
 		 479 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  25.72 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 457 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  25 
 
 		 445 aa  94  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 445 aa  94  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  25 
 
 		 462 aa  94  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  25 
 
 		 462 aa  94  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  25 
 
 		 445 aa  94  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  25 
 
 		 445 aa  94  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  27.29 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01631  methionine transporter (Eurofung)  24.75 
 
 		 540 aa  90.9  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.281549  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  21.5 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  21.5 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 474 aa  90.1  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  25.06 
 
 		 537 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 537 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 745 aa  89.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  21.5 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  21.81 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  21.5 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  21.5 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  21.5 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  21.5 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 537 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  21.74 
 
 		 467 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 786 aa  87  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  25.31 
 
 		 473 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02560  methionine transporter, putative (Eurofung)  23.53 
 
 		 560 aa  86.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.503958 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69488  high affinity methionine permease  24.05 
 
 		 551 aa  86.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.649926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  21.5 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.87 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  25.06 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  24.81 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  23.38 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  23.06 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 543 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>