More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0718 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  100 
 
 		 473 aa  927    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  37.01 
 
 		 485 aa  299  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  33.94 
 
 		 522 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  36.4 
 
 		 489 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  32.13 
 
 		 469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  35.11 
 
 		 473 aa  252  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  35.57 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  34.26 
 
 		 474 aa  247  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  32.62 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  38.29 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  33.05 
 
 		 490 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  32.62 
 
 		 443 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  35.26 
 
 		 472 aa  229  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  33.12 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  34.68 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  37.45 
 
 		 495 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  34.81 
 
 		 580 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  36.96 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  34.43 
 
 		 482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  32.07 
 
 		 440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  32.07 
 
 		 440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  32.29 
 
 		 452 aa  193  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  31.44 
 
 		 440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 467 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 448 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  29.68 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  30.9 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  31.12 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  30.9 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  31.03 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  30.54 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  30.54 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  31.61 
 
 		 437 aa  183  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  30.59 
 
 		 437 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  30.3 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 463 aa  180  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 		 453 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  30.52 
 
 		 435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  31.5 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  28.28 
 
 		 609 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  30.84 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  30.19 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 		 447 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  28.51 
 
 		 452 aa  167  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  32.29 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  30.39 
 
 		 387 aa  147  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 770 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 764 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  33.1 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  28.51 
 
 		 440 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  29.92 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  30.27 
 
 		 792 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  29.54 
 
 		 451 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  33.15 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 786 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  29.04 
 
 		 745 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  28.69 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  28.69 
 
 		 462 aa  123  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  28.69 
 
 		 462 aa  123  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  28.69 
 
 		 445 aa  123  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  28.69 
 
 		 445 aa  123  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 445 aa  123  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  28.69 
 
 		 445 aa  123  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  28.69 
 
 		 445 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  26.92 
 
 		 480 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2830  amino acid permease family protein  29.12 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 740 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  26.52 
 
 		 507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  25.4 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 495 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  29.21 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 820 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 481 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  27.78 
 
 		 446 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  25.22 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 466 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  26.71 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  25.9 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02560  methionine transporter, putative (Eurofung)  26.24 
 
 		 560 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.503958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  29.7 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01631  methionine transporter (Eurofung)  29.2 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.281549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  26.71 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 485 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  27.29 
 
 		 753 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 494 aa  103  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  23.15 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  26.98 
 
 		 474 aa  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  25.18 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>