More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1714 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 473 aa  941    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  60.55 
 
 		 469 aa  585  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  60.17 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  59.49 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  60.25 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  52.72 
 
 		 490 aa  491  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  44.31 
 
 		 522 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  36.15 
 
 		 489 aa  289  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  32.2 
 
 		 485 aa  249  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  34.89 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  32.61 
 
 		 461 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  32.12 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  35.45 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  31.91 
 
 		 445 aa  210  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  35.02 
 
 		 495 aa  206  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  32.49 
 
 		 463 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 		 482 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  28.1 
 
 		 458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  29.81 
 
 		 440 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  33.03 
 
 		 452 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  29.66 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 437 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  30.21 
 
 		 437 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  30.27 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  30.27 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  30.27 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  30.27 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  30.27 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  30.23 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  30.08 
 
 		 438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  26.47 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 448 aa  156  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  26.88 
 
 		 580 aa  146  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  29.92 
 
 		 442 aa  143  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  27.14 
 
 		 609 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  26.16 
 
 		 480 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  29.23 
 
 		 387 aa  136  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  26.8 
 
 		 452 aa  132  9e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 463 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 490 aa  119  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 537 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  25.21 
 
 		 451 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2830  amino acid permease family protein  24.77 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  25.61 
 
 		 541 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  25.63 
 
 		 451 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 537 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  25.69 
 
 		 537 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  25.75 
 
 		 541 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  27.49 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  27.49 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  27.49 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  27.49 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  27.49 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  25.12 
 
 		 519 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  25.92 
 
 		 664 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  26.84 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  27.75 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  25.12 
 
 		 642 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  25.75 
 
 		 666 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 543 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  25.12 
 
 		 642 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.56 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.56 
 
 		 471 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 471 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  25.57 
 
 		 541 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 541 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 541 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 541 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  22.08 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  24.78 
 
 		 512 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 471 aa  100  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 503 aa  100  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  24.37 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 541 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  26.87 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 529 aa  99  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.49 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>