More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3314 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  100 
 
 
442 aa  866    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  38.31 
 
 
437 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  37.86 
 
 
438 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  37.86 
 
 
438 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  37.86 
 
 
437 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  37.86 
 
 
437 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  37.64 
 
 
438 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  37.64 
 
 
438 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  37.28 
 
 
435 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  37.64 
 
 
438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  37.64 
 
 
438 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  37.11 
 
 
443 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  34.93 
 
 
453 aa  249  7e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  35.51 
 
 
440 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  35.51 
 
 
440 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  33.11 
 
 
443 aa  231  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  37.18 
 
 
387 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  35.71 
 
 
452 aa  206  7e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 
452 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
449 aa  176  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  29.41 
 
 
485 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 
469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  29 
 
 
473 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  27.9 
 
 
489 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  26.64 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 
499 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  27.47 
 
 
452 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  27.95 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 
467 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 
490 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 
452 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 
461 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 
444 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 
474 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  27.31 
 
 
609 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 
448 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  27.21 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  23.83 
 
 
522 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 
472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 
495 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  25.24 
 
 
445 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 
494 aa  107  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  24.94 
 
 
580 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.46 
 
 
483 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  23.6 
 
 
486 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  23.6 
 
 
486 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  25.06 
 
 
458 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  25.65 
 
 
466 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 
447 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 
495 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25 
 
 
490 aa  101  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 
566 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  25.97 
 
 
462 aa  100  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  24.44 
 
 
440 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 
496 aa  99.8  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.95 
 
 
471 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 
786 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 
485 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  24.38 
 
 
445 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 
445 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  24.38 
 
 
462 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  24.38 
 
 
445 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  24.38 
 
 
445 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  24.38 
 
 
462 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 
445 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  23.5 
 
 
491 aa  97.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  23.04 
 
 
512 aa  96.3  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 
476 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  24.16 
 
 
445 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  24.66 
 
 
462 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 
448 aa  93.2  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 
770 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 
501 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  22.57 
 
 
489 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 
476 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 
491 aa  89.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  21.63 
 
 
480 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  24.59 
 
 
476 aa  89.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 
764 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26.12 
 
 
463 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26.12 
 
 
463 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 
463 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 
494 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.69 
 
 
440 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 
495 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 
503 aa  87  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 
463 aa  87  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  25 
 
 
503 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  24.75 
 
 
480 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 
471 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 
516 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  24.19 
 
 
528 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  24 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>