More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0069 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 447 aa  868    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  63.11 
 
 		 458 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  47.7 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  42.08 
 
 		 463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  39.3 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  33.8 
 
 		 452 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2830  amino acid permease family protein  37.79 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  30.23 
 
 		 473 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  31.19 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  32.83 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  28.57 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  30.43 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 		 495 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  29.8 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  30.49 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  30.94 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  28.7 
 
 		 489 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 440 aa  142  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 440 aa  142  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  28.6 
 
 		 439 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  28 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  28.64 
 
 		 580 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  26.08 
 
 		 609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  27.83 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  24.65 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  26.71 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  31.09 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  25.51 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 453 aa  107  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 437 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  25.06 
 
 		 507 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  24.94 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  29.65 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  24.71 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  24.71 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  24.71 
 
 		 438 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  24.71 
 
 		 437 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  24.71 
 
 		 438 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 437 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  23.74 
 
 		 438 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 441 aa  93.6  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 436 aa  90.5  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.87 
 
 		 467 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.87 
 
 		 467 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.87 
 
 		 467 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  24.89 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.87 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.87 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.87 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  29.21 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.11 
 
 		 467 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.11 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  27.31 
 
 		 512 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  24.29 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.18 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 786 aa  83.2  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  27.32 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  27.32 
 
 		 642 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  27.32 
 
 		 642 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.48 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  28.03 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02560  methionine transporter, putative (Eurofung)  26.62 
 
 		 560 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.503958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  25.44 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  26.58 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>