More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4682 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  99.55 
 
 
445 aa  882    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  99.55 
 
 
445 aa  882    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  99.33 
 
 
445 aa  880    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  99.55 
 
 
445 aa  882    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  99.55 
 
 
462 aa  882    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  99.55 
 
 
462 aa  882    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  98.65 
 
 
462 aa  875    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  100 
 
 
445 aa  887    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  31.95 
 
 
453 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  28.25 
 
 
452 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  29.3 
 
 
485 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 
443 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 
463 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 
764 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  29.65 
 
 
495 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 
461 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  29.23 
 
 
443 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 
444 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 
740 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl605  putative amino acid/amine (lysine) APC transporter  28.4 
 
 
462 aa  139  7.999999999999999e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  27.05 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  27.48 
 
 
439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 
484 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  27.54 
 
 
438 aa  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  27.54 
 
 
437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  27.6 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  27.6 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  27.6 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  27.6 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  27.38 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  27.6 
 
 
438 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 
435 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  26.74 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 
437 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.78 
 
 
440 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 
773 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 
447 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 
745 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 
543 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 
555 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 
530 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 
495 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  26.54 
 
 
753 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 
467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 
532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  26.87 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  27.9 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  25.99 
 
 
451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.73 
 
 
483 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 
440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 
440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  25.73 
 
 
543 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 
770 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 
544 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 
576 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 
496 aa  116  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 
464 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  25.83 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  28.26 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  28.26 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  25.83 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 
532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  26.46 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  25.83 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  25.83 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 
499 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 
474 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  23.2 
 
 
522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 
455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  29.62 
 
 
436 aa  114  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  25.62 
 
 
533 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  28.9 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  28.9 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  28.9 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  28.9 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  25.42 
 
 
533 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 
518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 
520 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  25.42 
 
 
533 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 
532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  25.42 
 
 
533 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 
716 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 
473 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 
494 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 
463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 
786 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  23.87 
 
 
528 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  28.61 
 
 
445 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  29.23 
 
 
445 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 
445 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  29.23 
 
 
445 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 
496 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 
496 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  29.23 
 
 
445 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  29.23 
 
 
445 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  29.23 
 
 
445 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  29.23 
 
 
445 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>