More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0619 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  70.51 
 
 		 500 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  71.43 
 
 		 499 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0619  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 497 aa  996    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  70.3 
 
 		 500 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  68.22 
 
 		 496 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  70.45 
 
 		 500 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3512  amino acid permease-associated region  69.9 
 
 		 498 aa  701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  normal  0.430262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  70.3 
 
 		 494 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  70.42 
 
 		 499 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  70.45 
 
 		 500 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  70.42 
 
 		 499 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  70.42 
 
 		 499 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  70.42 
 
 		 499 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  70.42 
 
 		 499 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  70.3 
 
 		 494 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  69.08 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0945  amino acid permease  69.08 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  69.08 
 
 		 496 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  69.08 
 
 		 496 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0346  amino acid permease  69.08 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362616  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  69.4 
 
 		 496 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  69.18 
 
 		 467 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1029  amino acid permease  67.69 
 
 		 497 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11210  putative amino acid permease  68.11 
 
 		 496 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.878559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  29.73 
 
 		 479 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 459 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  31.16 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  30.97 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  30.69 
 
 		 464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 451 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26.1 
 
 		 437 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  26.1 
 
 		 438 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  26.1 
 
 		 438 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26.1 
 
 		 437 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26.1 
 
 		 438 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  26.04 
 
 		 438 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  26.1 
 
 		 438 aa  90.1  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  26.1 
 
 		 438 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  31.7 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  26.7 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.13 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.13 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.47 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.47 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  26.22 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  23.31 
 
 		 716 aa  77  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 773 aa  75.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  29.85 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  26.55 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  29.35 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 515 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 549 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  24.65 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 521 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  22.96 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.18 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  30.49 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  34.75 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.05 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  26.07 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  25.26 
 
 		 636 aa  67.8  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 490 aa  67.4  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  25.32 
 
 		 446 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 442 aa  67  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 438 aa  67  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  26.3 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  26.28 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  30.8 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  28.62 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  27.02 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.64 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  24.05 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  23.09 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  26.49 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  24.04 
 
 		 522 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>