More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1029 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  69.08 
 
 		 500 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0619  amino acid permease-associated region  67.69 
 
 		 497 aa  676    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  68.87 
 
 		 500 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1029  amino acid permease  100 
 
 		 497 aa  981    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  69.08 
 
 		 500 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  68.87 
 
 		 496 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  69.08 
 
 		 494 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3512  amino acid permease-associated region  76.36 
 
 		 498 aa  767    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  normal  0.430262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  68.44 
 
 		 499 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  69.08 
 
 		 494 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  69.08 
 
 		 500 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11210  putative amino acid permease  96.18 
 
 		 496 aa  847    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.878559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0945  amino acid permease  68.66 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  66.05 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  68.66 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0346  amino acid permease  68.66 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362616  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  68.66 
 
 		 496 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  68.66 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  66.05 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  66.05 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  66.05 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  68.97 
 
 		 496 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  65.64 
 
 		 499 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  68.75 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  29.6 
 
 		 479 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  32.03 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  31.25 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  29.16 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 773 aa  89.7  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  29.86 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  29.86 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 451 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  29.32 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  29.32 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.39 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  31.98 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  24.67 
 
 		 438 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  28.2 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  25.92 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  30.34 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  23.6 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  26.53 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  23.75 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  28.08 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  24.38 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  24.38 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  24.22 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  24.22 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  24.38 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  28.08 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  31.97 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  33.04 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  26.87 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  26.87 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  26.87 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  26.87 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  30.09 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  30.09 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.21 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  30.09 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  30.1 
 
 		 476 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 481 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 518 aa  73.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  23.9 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 515 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  27.09 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  29.65 
 
 		 467 aa  72  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  27.16 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  28.28 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  28.28 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  22.94 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.66 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  30.29 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  25.64 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  30.54 
 
 		 538 aa  70.1  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  26.05 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.84 
 
 		 449 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0973  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 651 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>