More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0306 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  100 
 
 		 477 aa  932    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  99.16 
 
 		 477 aa  924    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  55.48 
 
 		 479 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  43.01 
 
 		 464 aa  361  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  43.11 
 
 		 459 aa  358  8e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  33.55 
 
 		 496 aa  220  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  32.9 
 
 		 500 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  33.12 
 
 		 500 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  33.12 
 
 		 494 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  33.12 
 
 		 494 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  33.77 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  32.9 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  32.9 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0945  amino acid permease  32.9 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  32.9 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0346  amino acid permease  32.9 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362616  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  34.13 
 
 		 500 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  33.11 
 
 		 496 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  32.69 
 
 		 496 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  31.38 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  31.38 
 
 		 499 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  31.38 
 
 		 499 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  31.38 
 
 		 499 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  31.38 
 
 		 499 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0619  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 		 497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3512  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 498 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  normal  0.430262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1029  amino acid permease  31.87 
 
 		 497 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11210  putative amino acid permease  32.49 
 
 		 496 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.878559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  30.3 
 
 		 477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  30.42 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  29.68 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  29.27 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  28.47 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  29.2 
 
 		 470 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  29.2 
 
 		 470 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  29.8 
 
 		 716 aa  109  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  29.02 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  29.02 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  29.02 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  29.85 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  27.41 
 
 		 455 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  28.08 
 
 		 467 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  29.42 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 439 aa  103  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  30.4 
 
 		 725 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  27.52 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  30.67 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  26.96 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 773 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  26.22 
 
 		 495 aa  101  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  29.1 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  29.1 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  29.1 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  29.1 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  29.1 
 
 		 469 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  29.1 
 
 		 469 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  27.52 
 
 		 473 aa  99.8  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 455 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  29.44 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  28.26 
 
 		 456 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  28.86 
 
 		 469 aa  97.8  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  26.38 
 
 		 443 aa  97.1  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  28.86 
 
 		 469 aa  97.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  28.68 
 
 		 463 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  28.39 
 
 		 469 aa  97.1  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.85 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  28.06 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  28.88 
 
 		 457 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  27.79 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 466 aa  94.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  26.75 
 
 		 452 aa  94  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  27.68 
 
 		 470 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 431 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 494 aa  93.6  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 431 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  29.23 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  29.06 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 474 aa  92.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  24.86 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 494 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 485 aa  91.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 456 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  28.22 
 
 		 458 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 467 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 474 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 491 aa  89.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  29.56 
 
 		 473 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 447 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  29.15 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>