More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3325 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  87.42 
 
 		 467 aa  818    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  100 
 
 		 469 aa  922    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  100 
 
 		 469 aa  922    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  92.77 
 
 		 461 aa  855    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  99.79 
 
 		 469 aa  920    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  80.37 
 
 		 455 aa  692    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  74.16 
 
 		 456 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  78 
 
 		 477 aa  704    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  92.34 
 
 		 470 aa  862    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  73.39 
 
 		 469 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  99.79 
 
 		 469 aa  920    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  70.8 
 
 		 474 aa  639    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  100 
 
 		 469 aa  922    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  98.51 
 
 		 469 aa  910    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  79.86 
 
 		 467 aa  693    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  72.73 
 
 		 463 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  86.57 
 
 		 467 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  73.05 
 
 		 470 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  71.02 
 
 		 470 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  92.55 
 
 		 470 aa  865    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  80.04 
 
 		 463 aa  718    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  92.55 
 
 		 470 aa  864    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  92.55 
 
 		 470 aa  863    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  89.28 
 
 		 467 aa  820    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  92.55 
 
 		 470 aa  863    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  100 
 
 		 469 aa  922    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  99.57 
 
 		 469 aa  918    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  92.55 
 
 		 470 aa  864    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  73.27 
 
 		 454 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  69.96 
 
 		 456 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  71.24 
 
 		 457 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  70.5 
 
 		 458 aa  627  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  71.94 
 
 		 454 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  70.89 
 
 		 473 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  69.82 
 
 		 458 aa  620  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  71.94 
 
 		 454 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  68.75 
 
 		 455 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  68.3 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  71.82 
 
 		 453 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  53.94 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  47.99 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  46.99 
 
 		 445 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  42.56 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  39.91 
 
 		 467 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  39.28 
 
 		 482 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  40.05 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  39.16 
 
 		 482 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  39.81 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  39.81 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  38.69 
 
 		 482 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  36.02 
 
 		 483 aa  236  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  37.53 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  36.76 
 
 		 467 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  36.76 
 
 		 467 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  36.76 
 
 		 467 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  36.73 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  40.4 
 
 		 488 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  37.29 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  35.1 
 
 		 479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  34.84 
 
 		 499 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  35.63 
 
 		 467 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  35.38 
 
 		 463 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  38.63 
 
 		 469 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  34.69 
 
 		 486 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  36.93 
 
 		 471 aa  210  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  37.41 
 
 		 505 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  35.9 
 
 		 486 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  35.15 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  35.84 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  37.56 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 497 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  31.81 
 
 		 509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  31.81 
 
 		 509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  31.81 
 
 		 509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  31.04 
 
 		 456 aa  176  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  29.67 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  29.42 
 
 		 483 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 465 aa  133  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  33.92 
 
 		 443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29.77 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 495 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.39 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.75 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.75 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.26 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  28.26 
 
 		 471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.09 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  28.84 
 
 		 485 aa  117  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  26.68 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 792 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  28.81 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 466 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  26.68 
 
 		 467 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>