More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5504 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  96.8 
 
 		 500 aa  934    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 500 aa  987    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  89.7 
 
 		 467 aa  823    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  90.04 
 
 		 496 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  89.83 
 
 		 496 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  89.7 
 
 		 496 aa  824    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  89.83 
 
 		 496 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  97.8 
 
 		 500 aa  973    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0619  amino acid permease-associated region  70.3 
 
 		 497 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  87.95 
 
 		 496 aa  852    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0346  amino acid permease  89.83 
 
 		 496 aa  833    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3512  amino acid permease-associated region  69.34 
 
 		 498 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  normal  0.430262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  94.79 
 
 		 499 aa  897    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 494 aa  974    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0945  amino acid permease  89.83 
 
 		 496 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  96.8 
 
 		 500 aa  935    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 494 aa  974    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1029  amino acid permease  69.08 
 
 		 497 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11210  putative amino acid permease  70.15 
 
 		 496 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.878559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  62.98 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  62.98 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  62.98 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  62.98 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  62.98 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  32.11 
 
 		 479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  33.33 
 
 		 477 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  33.12 
 
 		 477 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  30.38 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  28.72 
 
 		 458 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 451 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  28.46 
 
 		 458 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  28.35 
 
 		 456 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  29 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  25.2 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 517 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.38 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 		 501 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  31.32 
 
 		 455 aa  87.4  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  26.11 
 
 		 470 aa  86.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  26.38 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  26.02 
 
 		 470 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  24.61 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  28.12 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  26.02 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  34.15 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  34.15 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  25.06 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 773 aa  83.2  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  26.02 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 481 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  25.59 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.17 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  26.02 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.9 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  26.02 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  26.02 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  25.59 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  25.59 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  25.13 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  25.59 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  25.59 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  33.82 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  25.59 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  29.7 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  25.59 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  33.82 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  24.28 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 496 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 496 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  26.22 
 
 		 525 aa  79.7  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  26.6 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.17 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25.17 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  30.58 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  25.82 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  24.94 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  25.58 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  24.94 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  25.58 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  25.58 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  24.94 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  26.38 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>