More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1042 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  100 
 
 
773 aa  1532    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  43.19 
 
 
716 aa  552  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  45.39 
 
 
725 aa  533  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  39.77 
 
 
740 aa  491  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  47.64 
 
 
465 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  31.19 
 
 
753 aa  316  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  31.75 
 
 
764 aa  308  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  31.14 
 
 
770 aa  300  9e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  40.25 
 
 
641 aa  297  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 
786 aa  290  7e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  28.91 
 
 
745 aa  282  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 
820 aa  256  9e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 
792 aa  238  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  35.18 
 
 
473 aa  225  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 
474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  36.05 
 
 
475 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  34.8 
 
 
479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 
506 aa  153  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 
476 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 
796 aa  143  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  28.77 
 
 
525 aa  140  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  29.8 
 
 
476 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  30.2 
 
 
500 aa  139  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 
486 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.75 
 
 
495 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 
518 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 
494 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.91 
 
 
489 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  31.82 
 
 
452 aa  132  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 
538 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  29.34 
 
 
441 aa  126  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 
481 aa  126  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 
495 aa  127  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  32 
 
 
431 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 
490 aa  125  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  29.38 
 
 
476 aa  125  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.95 
 
 
476 aa  124  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 
481 aa  124  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 
549 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 
518 aa  124  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  28.82 
 
 
462 aa  124  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  28.82 
 
 
462 aa  124  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  28.82 
 
 
445 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 
445 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  28.82 
 
 
445 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  28.82 
 
 
445 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 
486 aa  123  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  28.82 
 
 
445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  30.86 
 
 
447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  28.9 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 
456 aa  122  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  29.43 
 
 
443 aa  122  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  29.16 
 
 
485 aa  122  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  28.92 
 
 
474 aa  121  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
462 aa  120  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.5 
 
 
471 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.5 
 
 
471 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 
500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 
491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  29.46 
 
 
485 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3585  amino acid permease-associated region  32.96 
 
 
764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  27.97 
 
 
462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 
482 aa  117  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 
482 aa  117  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.28 
 
 
471 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.28 
 
 
471 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  29.11 
 
 
437 aa  117  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.72 
 
 
467 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 
471 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 
476 aa  116  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  30.63 
 
 
431 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.5 
 
 
467 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 
437 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.5 
 
 
467 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  26.96 
 
 
483 aa  114  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1905  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 
812 aa  114  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 
464 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.5 
 
 
467 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  28.72 
 
 
481 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.33 
 
 
460 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26.59 
 
 
437 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  27.19 
 
 
443 aa  113  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  26.59 
 
 
438 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.5 
 
 
467 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  26.35 
 
 
438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.5 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  26.59 
 
 
438 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 
566 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.44 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 
489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26.59 
 
 
437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26.35 
 
 
438 aa  112  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 
481 aa  112  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  26.35 
 
 
438 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 
435 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  26.35 
 
 
438 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.72 
 
 
471 aa  111  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 
471 aa  111  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 
495 aa  111  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.72 
 
 
471 aa  111  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>