More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1907 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 486 aa  961    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  55.7 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  54.85 
 
 		 480 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  53.74 
 
 		 468 aa  488  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  52.77 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  53.88 
 
 		 468 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  49.2 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0244  amino acid permease-associated region  50.33 
 
 		 475 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.912876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0232  amino acid permease family protein  30.38 
 
 		 496 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0221  amino acid permease-associated region  29.07 
 
 		 490 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  31.18 
 
 		 502 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0621  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 		 494 aa  203  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0607  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 		 494 aa  203  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21570  amino acid transporter  29.9 
 
 		 503 aa  182  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.393168  hitchhiker  0.00168939 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0717  amino acid permease family protein  28.12 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0730  amino acid permease family protein  28.34 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1276  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 480 aa  173  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3189  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 482 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22930  amino acid transporter  28.12 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0974202 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  28.27 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.52 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 		 496 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 		 492 aa  144  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 549 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 500 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 491 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0152  amino acid permease family protein  24.22 
 
 		 451 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237797  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 476 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.73 
 
 		 467 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.35 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.77 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.42 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.42 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  26.35 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 495 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.57 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.57 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 501 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 496 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 496 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  26.69 
 
 		 476 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.84 
 
 		 486 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.84 
 
 		 486 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 		 518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.22 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  28.66 
 
 		 471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.66 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 		 466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 513 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 468 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  28.45 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.62 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  28.45 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 476 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.02 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  27.1 
 
 		 465 aa  126  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  27.77 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 486 aa  123  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  27.77 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  27.77 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  27.77 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  27.77 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  27.77 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  27.77 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  27.56 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  27.76 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 506 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 503 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  27.37 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.83 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  23.85 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  26.89 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  23.85 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  23.85 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  25 
 
 		 480 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  26.29 
 
 		 466 aa  118  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>