More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0244 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0244  amino acid permease-associated region  100 
 
 
475 aa  912    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.912876  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  65.18 
 
 
468 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  58.9 
 
 
471 aa  521  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  50.23 
 
 
468 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  50.33 
 
 
486 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  49.44 
 
 
480 aa  410  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  48.2 
 
 
479 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  46.39 
 
 
480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 
502 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0221  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 
490 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22930  amino acid transporter  31.1 
 
 
494 aa  173  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0974202 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0232  amino acid permease family protein  28.9 
 
 
496 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21570  amino acid transporter  31.9 
 
 
503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.393168  hitchhiker  0.00168939 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0621  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 
494 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0607  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 
494 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1276  amino acid permease-associated region  30.05 
 
 
480 aa  154  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3189  amino acid permease-associated region  29.45 
 
 
482 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0730  amino acid permease family protein  25.5 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0717  amino acid permease family protein  26.03 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  31.72 
 
 
491 aa  133  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  30.55 
 
 
792 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  29.48 
 
 
485 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  27.11 
 
 
503 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  31.12 
 
 
770 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  29.79 
 
 
486 aa  124  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  29.79 
 
 
486 aa  124  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.84 
 
 
506 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 
496 aa  124  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.45 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  27.57 
 
 
483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 
517 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  30.5 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 
786 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 
455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 
482 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 
486 aa  117  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 
439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 
566 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.86 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.86 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.86 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 
549 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 
491 aa  113  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  32.13 
 
 
488 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 
466 aa  113  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  30.31 
 
 
468 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0152  amino acid permease family protein  23.79 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.77 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.36 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.56 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.56 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.36 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.36 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  27.48 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  27.48 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  25.68 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  27.48 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 
518 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 
488 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.2 
 
 
467 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  28.12 
 
 
463 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 
473 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  27.48 
 
 
470 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 
521 aa  110  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 
500 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 
495 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  28.37 
 
 
469 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  28.37 
 
 
469 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  28.37 
 
 
469 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  28.37 
 
 
469 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  28.37 
 
 
469 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  28.37 
 
 
469 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  28.37 
 
 
469 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 
501 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  30.88 
 
 
468 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  27.37 
 
 
470 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 
478 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 
458 aa  108  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.54 
 
 
467 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26.75 
 
 
463 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  27.16 
 
 
467 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  26.84 
 
 
470 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  27.38 
 
 
467 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  27.02 
 
 
467 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
476 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 
555 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  25.56 
 
 
467 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26.75 
 
 
463 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  29.68 
 
 
436 aa  107  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 
476 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  26.86 
 
 
471 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 
467 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 
471 aa  106  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.58 
 
 
476 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  26.89 
 
 
461 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 
494 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 
481 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  28.09 
 
 
469 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>