More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2908 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  100 
 
 		 636 aa  1279    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2910  UspA domain protein  35.43 
 
 		 649 aa  330  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12405  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  33.76 
 
 		 455 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 431 aa  135  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 439 aa  133  9e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.42 
 
 		 422 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 436 aa  118  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  27.8 
 
 		 446 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 495 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.67 
 
 		 489 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 454 aa  101  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  27.71 
 
 		 461 aa  100  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.33 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.33 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 479 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 496 aa  98.6  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 455 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  26.54 
 
 		 433 aa  98.2  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 494 aa  98.2  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 786 aa  98.2  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 483 aa  97.4  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 473 aa  97.1  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  28.05 
 
 		 454 aa  96.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  26.73 
 
 		 467 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 485 aa  95.9  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  23.05 
 
 		 486 aa  96.3  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  26.69 
 
 		 470 aa  96.3  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  26.48 
 
 		 467 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  27.18 
 
 		 445 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.96 
 
 		 483 aa  95.1  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 486 aa  95.1  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  26.34 
 
 		 470 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  21.99 
 
 		 764 aa  94.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 490 aa  94.4  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 478 aa  94.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  25.35 
 
 		 460 aa  94  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  27.35 
 
 		 477 aa  93.6  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 444 aa  93.2  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0055  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 428 aa  93.6  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 493 aa  92.8  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 		 472 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  25.29 
 
 		 503 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  20.82 
 
 		 770 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 486 aa  92  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 477 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 496 aa  91.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 451 aa  91.3  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  29.06 
 
 		 461 aa  91.3  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  27.21 
 
 		 467 aa  90.9  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1335  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 430 aa  90.5  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.654483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  22.27 
 
 		 480 aa  90.1  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  25.45 
 
 		 443 aa  90.1  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 510 aa  90.1  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 792 aa  89.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  25.92 
 
 		 461 aa  89.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  26.08 
 
 		 470 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 796 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 476 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 452 aa  88.2  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 466 aa  88.6  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 500 aa  88.2  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  25.87 
 
 		 470 aa  87.8  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  25.72 
 
 		 470 aa  88.2  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  25.72 
 
 		 470 aa  88.2  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 438 aa  87.8  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 438 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 461 aa  87  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 474 aa  87.4  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 		 500 aa  87  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  25.69 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 451 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 491 aa  86.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  26.22 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 		 518 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  24.73 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  25.06 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  24.73 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  22.82 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 745 aa  85.1  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  27.46 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  25.47 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  24.78 
 
 		 525 aa  84.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  29.9 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>