More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2056 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 509 aa  993    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 509 aa  993    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 509 aa  993    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  47.53 
 
 		 500 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  46.98 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  43.36 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  43.46 
 
 		 485 aa  352  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  41.73 
 
 		 505 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  39.75 
 
 		 482 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  41.23 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  39.33 
 
 		 482 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  40.62 
 
 		 482 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  40.67 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  42.62 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  42.8 
 
 		 467 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  42.8 
 
 		 467 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  42.8 
 
 		 467 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  40.9 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  42.41 
 
 		 483 aa  317  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  40.04 
 
 		 482 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  40.04 
 
 		 482 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  41.41 
 
 		 486 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  44.35 
 
 		 468 aa  309  9e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  41.81 
 
 		 488 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  39.06 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  39 
 
 		 486 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  39.87 
 
 		 467 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  42.55 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  41.09 
 
 		 479 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  42.25 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  42.07 
 
 		 469 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  43.42 
 
 		 490 aa  266  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  32.47 
 
 		 441 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  31.68 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  31.91 
 
 		 467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  31.7 
 
 		 467 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  32.32 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  32.19 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  33.17 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  33.58 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  31.48 
 
 		 470 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  32.08 
 
 		 469 aa  187  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  31.96 
 
 		 456 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  31.81 
 
 		 461 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 454 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  31.02 
 
 		 470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  32.85 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  32.28 
 
 		 469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  30.33 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  30.79 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  30.79 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  31.64 
 
 		 474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  32.04 
 
 		 469 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  31.02 
 
 		 470 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  32.04 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  32.04 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  34.2 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  32.04 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  32.04 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  32.04 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  34.06 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  32.04 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  30.79 
 
 		 470 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  30.82 
 
 		 458 aa  180  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  34.2 
 
 		 454 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  30.43 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  35.32 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  34.25 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  32.01 
 
 		 456 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  34.73 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  30.14 
 
 		 458 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  33.57 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  33.82 
 
 		 473 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  30.75 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  31.97 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 483 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  28.33 
 
 		 467 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  25.66 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 527 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1805  amino acid permease-associated region  30.08 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607317  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  23.92 
 
 		 474 aa  97.8  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 483 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  27.6 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  28.08 
 
 		 475 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 466 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 472 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  24.53 
 
 		 479 aa  93.2  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01910  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  25.81 
 
 		 488 aa  93.2  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  22.88 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 494 aa  93.2  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  22.88 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  23.09 
 
 		 467 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  23.09 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  25.25 
 
 		 468 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 		 455 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  25.7 
 
 		 459 aa  90.9  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  23.09 
 
 		 467 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.15 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>