More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3632 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  100 
 
 		 488 aa  934    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  74.57 
 
 		 467 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  74.57 
 
 		 467 aa  683    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  74.57 
 
 		 467 aa  683    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  71.34 
 
 		 479 aa  665    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  70.91 
 
 		 479 aa  623  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  71.76 
 
 		 469 aa  618  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  72.59 
 
 		 490 aa  613  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  70.49 
 
 		 479 aa  605  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  67.02 
 
 		 480 aa  590  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  63.58 
 
 		 482 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  64.21 
 
 		 482 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  63.58 
 
 		 482 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  63.37 
 
 		 482 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  63.37 
 
 		 482 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  63.79 
 
 		 482 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  64.66 
 
 		 483 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  60.25 
 
 		 486 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  66.24 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  56.76 
 
 		 486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  56.1 
 
 		 468 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  54.01 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  53.78 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  49.78 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  41.92 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  41.75 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  41.75 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  41.75 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  41.78 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  45.82 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  42.6 
 
 		 505 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  40.08 
 
 		 497 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  38.06 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  37.85 
 
 		 467 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  36.55 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  38.7 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  34.47 
 
 		 441 aa  239  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  40.86 
 
 		 470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  40.51 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  40.38 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  41.12 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  41.12 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  40.86 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  39.82 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  40.86 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  40.86 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  40.86 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  40.86 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  40.86 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  40.86 
 
 		 469 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  38.66 
 
 		 474 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  40.86 
 
 		 469 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  40.86 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  40.86 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  37.92 
 
 		 454 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  40.86 
 
 		 470 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  40.86 
 
 		 470 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  38.83 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  38.44 
 
 		 454 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  36.78 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  37.25 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  38.87 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  38.65 
 
 		 457 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  40.14 
 
 		 458 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  38 
 
 		 456 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  39.62 
 
 		 456 aa  229  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  42.49 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  39.05 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  37.72 
 
 		 454 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  40.21 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  38.5 
 
 		 455 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  38.07 
 
 		 455 aa  217  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  35.64 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  36.64 
 
 		 495 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  35.29 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  31.77 
 
 		 467 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  28.72 
 
 		 456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 466 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  30.47 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  29.47 
 
 		 471 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 515 aa  115  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  30.27 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 515 aa  110  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 468 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 468 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 468 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  28.03 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.84 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  23.49 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  23.49 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.14 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.14 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  23.49 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 513 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>