More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0774 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  100 
 
 
485 aa  951    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  64.21 
 
 
499 aa  609  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  58.99 
 
 
505 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  43.6 
 
 
509 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  43.6 
 
 
509 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  43.6 
 
 
509 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  46.36 
 
 
500 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  46.49 
 
 
482 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  46.07 
 
 
482 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  48.18 
 
 
467 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  46.53 
 
 
467 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  46.53 
 
 
467 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  46.53 
 
 
467 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  45.61 
 
 
482 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  45.14 
 
 
479 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  46.61 
 
 
480 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  45.09 
 
 
483 aa  363  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  45.89 
 
 
482 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  45.71 
 
 
486 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  45.05 
 
 
482 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  43.92 
 
 
463 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  45.05 
 
 
482 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  42.11 
 
 
467 aa  350  4e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  45.82 
 
 
488 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  43.07 
 
 
468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  43.52 
 
 
486 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  45.49 
 
 
479 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  45.25 
 
 
469 aa  326  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  41.84 
 
 
497 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  44.44 
 
 
471 aa  323  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  44.74 
 
 
479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  45.85 
 
 
490 aa  310  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  42.37 
 
 
458 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  39.87 
 
 
474 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  38.24 
 
 
463 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  40.13 
 
 
458 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  38.61 
 
 
456 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  38.81 
 
 
455 aa  257  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  41.43 
 
 
456 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  36.71 
 
 
467 aa  257  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  38.97 
 
 
455 aa  256  7e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  36.4 
 
 
461 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  40.14 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  37.72 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  36.47 
 
 
467 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  40.66 
 
 
455 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  36.38 
 
 
470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  36.38 
 
 
470 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  36.38 
 
 
470 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  40.2 
 
 
470 aa  252  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  36.76 
 
 
463 aa  252  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  37.53 
 
 
467 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  35.68 
 
 
470 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  38.94 
 
 
469 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  35.84 
 
 
470 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  35.68 
 
 
470 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  39.08 
 
 
470 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  39.04 
 
 
457 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  37.2 
 
 
453 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  37.56 
 
 
469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  37.56 
 
 
469 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  37.56 
 
 
469 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  37.56 
 
 
469 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  37.56 
 
 
469 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  37.56 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  36.78 
 
 
454 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  37.56 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  39.29 
 
 
445 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  39.35 
 
 
473 aa  242  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  37.32 
 
 
469 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  34.15 
 
 
477 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  37.12 
 
 
445 aa  229  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  37.56 
 
 
467 aa  225  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  34.76 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  33.4 
 
 
495 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  31.85 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  30.16 
 
 
456 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  32.96 
 
 
443 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 
483 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.51 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  26.04 
 
 
468 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  25.39 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.87 
 
 
468 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 
468 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 
466 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 
466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 
471 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  28.88 
 
 
471 aa  117  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.93 
 
 
471 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  26.28 
 
 
458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.72 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.25 
 
 
467 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.71 
 
 
471 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.71 
 
 
471 aa  115  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>