More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0304 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  79.07 
 
 
454 aa  711    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  95.38 
 
 
455 aa  843    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  100 
 
 
455 aa  906    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  79.74 
 
 
454 aa  714    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  80.79 
 
 
454 aa  718    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  80.97 
 
 
456 aa  720    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  82.88 
 
 
453 aa  697    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  70.9 
 
 
474 aa  636    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  69.04 
 
 
467 aa  634    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  68.75 
 
 
469 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  68.75 
 
 
469 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  68.75 
 
 
469 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  68.75 
 
 
469 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  69.46 
 
 
463 aa  633  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  68.53 
 
 
469 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  69.04 
 
 
467 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  68.53 
 
 
469 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  68.3 
 
 
469 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  67.93 
 
 
467 aa  626  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  68.37 
 
 
461 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  71.88 
 
 
470 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  67.86 
 
 
470 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  70.55 
 
 
473 aa  619  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  67.86 
 
 
470 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  67.41 
 
 
470 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  67.41 
 
 
470 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  69.3 
 
 
470 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  66.96 
 
 
470 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  66.96 
 
 
470 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  67.55 
 
 
477 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  69.04 
 
 
469 aa  608  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  70.98 
 
 
463 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  67.11 
 
 
457 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  67.49 
 
 
458 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  68.36 
 
 
469 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  67.26 
 
 
456 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  67.04 
 
 
458 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  69.21 
 
 
467 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  70.18 
 
 
455 aa  594  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  51.52 
 
 
445 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  49.23 
 
 
441 aa  425  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  49.12 
 
 
445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  41.37 
 
 
495 aa  320  3.9999999999999996e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  41.85 
 
 
467 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  39.43 
 
 
485 aa  243  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  36.06 
 
 
482 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  35.55 
 
 
499 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  35.5 
 
 
482 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  35.7 
 
 
482 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  36.06 
 
 
482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  35.38 
 
 
483 aa  234  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  35.56 
 
 
467 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  35.56 
 
 
467 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  35.56 
 
 
467 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  36.06 
 
 
482 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  36.06 
 
 
482 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  37.9 
 
 
479 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  36.72 
 
 
486 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  35.59 
 
 
479 aa  229  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  37.53 
 
 
480 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  39.02 
 
 
486 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  35.87 
 
 
467 aa  225  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  39.56 
 
 
469 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  38.83 
 
 
488 aa  216  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  35.97 
 
 
505 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  36.56 
 
 
479 aa  213  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  34.2 
 
 
500 aa  211  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  35.17 
 
 
463 aa  211  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  37 
 
 
471 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  35.28 
 
 
468 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  37.91 
 
 
490 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  34.73 
 
 
509 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  34.73 
 
 
509 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  34.73 
 
 
509 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  35.53 
 
 
497 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  28.66 
 
 
456 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  28.5 
 
 
467 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  29.65 
 
 
483 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 
465 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  30.66 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29.52 
 
 
455 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.74 
 
 
422 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 
462 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 
462 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 
468 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  26.15 
 
 
467 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 
468 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 
468 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 
462 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 
462 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  24.17 
 
 
491 aa  100  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 
468 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.55 
 
 
489 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 
466 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 
466 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  25.69 
 
 
467 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  25.69 
 
 
467 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 
482 aa  97.8  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>