More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2026 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  71.05 
 
 		 467 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  72.1 
 
 		 470 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  100 
 
 		 454 aa  899    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  78.41 
 
 		 455 aa  707    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  71.71 
 
 		 461 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  71.65 
 
 		 457 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  70.54 
 
 		 470 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  72.1 
 
 		 469 aa  646    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  71.27 
 
 		 467 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  96.92 
 
 		 454 aa  848    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  71.94 
 
 		 469 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  71.94 
 
 		 469 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  72.1 
 
 		 469 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  90.29 
 
 		 454 aa  795    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  86.73 
 
 		 456 aa  771    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  72.54 
 
 		 470 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  71.18 
 
 		 474 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  71.95 
 
 		 463 aa  649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  71.05 
 
 		 467 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  71.88 
 
 		 469 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  71.65 
 
 		 470 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  72.1 
 
 		 469 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  70.39 
 
 		 470 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  70.6 
 
 		 470 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  79.05 
 
 		 453 aa  665    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  72.1 
 
 		 469 aa  646    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  71.65 
 
 		 470 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  79.07 
 
 		 455 aa  712    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  70.79 
 
 		 458 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  72.92 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  71.68 
 
 		 470 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  70.34 
 
 		 458 aa  628  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  69.93 
 
 		 477 aa  627  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  69.11 
 
 		 456 aa  627  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  70.6 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  70.8 
 
 		 473 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  70.29 
 
 		 463 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  70.11 
 
 		 455 aa  609  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  70.81 
 
 		 467 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  53.27 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  50.67 
 
 		 441 aa  435  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  50.47 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  44.24 
 
 		 495 aa  323  3e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  41.75 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  37.74 
 
 		 483 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  37.58 
 
 		 482 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  38.65 
 
 		 482 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  40.14 
 
 		 485 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  37.06 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  37.06 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  36.91 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  37.06 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  39.17 
 
 		 482 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  39.18 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  38.69 
 
 		 482 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  38.69 
 
 		 482 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  38.05 
 
 		 486 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  37.75 
 
 		 479 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  37.02 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  37.53 
 
 		 486 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  34.77 
 
 		 499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  36.08 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  36.14 
 
 		 463 aa  230  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  36.18 
 
 		 479 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  39.59 
 
 		 488 aa  229  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  36.44 
 
 		 505 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  35.71 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  38.21 
 
 		 471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  37 
 
 		 469 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  37.09 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  39.25 
 
 		 490 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  34.2 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  34.2 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  34.2 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  33.83 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  29.68 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  29.22 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 483 aa  136  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  32.67 
 
 		 443 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  30.32 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.86 
 
 		 422 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  29.02 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  29.02 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  29.02 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  29.02 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  28.36 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  28.36 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  28.36 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  28.36 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.96 
 
 		 489 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 492 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 481 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 481 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.29 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  26.86 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>