More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1379 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  100 
 
 		 445 aa  874    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  60.68 
 
 		 441 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  59.72 
 
 		 445 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  51.61 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  50.82 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  47.77 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  50.46 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  47.77 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  47.77 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  47.1 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  47.3 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  47.3 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  47.3 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  46.72 
 
 		 477 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  47.54 
 
 		 470 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  47.97 
 
 		 467 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  48.34 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  49.06 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  47.3 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  48.82 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  48.28 
 
 		 456 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  47.3 
 
 		 469 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  50.8 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  48.34 
 
 		 473 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  47.07 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  48.82 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  46.65 
 
 		 470 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  48.47 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  48.05 
 
 		 461 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  47.3 
 
 		 469 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  47.75 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  49.12 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  47.52 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  47.47 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  47.56 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  50.47 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  47.35 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  50.47 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  48.61 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  51.19 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  46.43 
 
 		 467 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  49.76 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  42.14 
 
 		 495 aa  325  9e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  40.46 
 
 		 467 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  38.02 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  36.12 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  35.7 
 
 		 467 aa  217  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  36.36 
 
 		 482 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  36.61 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  35.4 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  36.36 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  35.4 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  36.36 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  35.28 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  35.28 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  35.28 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  35.81 
 
 		 488 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  37.12 
 
 		 485 aa  202  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  36.02 
 
 		 486 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  34.34 
 
 		 479 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  34.32 
 
 		 463 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  36.8 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  35.09 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  33.17 
 
 		 509 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  34.18 
 
 		 483 aa  189  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  33.17 
 
 		 509 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  33.17 
 
 		 509 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  35.26 
 
 		 471 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  33.5 
 
 		 479 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 		 500 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  31.28 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  34.22 
 
 		 479 aa  179  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  33.56 
 
 		 469 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  33.25 
 
 		 505 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 		 497 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  28.6 
 
 		 456 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  28.45 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 		 483 aa  136  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  32.64 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  26.95 
 
 		 471 aa  123  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.32 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  26.53 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.32 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.32 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 		 471 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  26.53 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  26.32 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  26.11 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  26.36 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.47 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.94 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.94 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.94 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.94 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.94 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.94 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.19 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>