More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4353 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 443 aa  857    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  41.03 
 
 		 482 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  41.26 
 
 		 482 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  40.36 
 
 		 482 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  41.26 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  40.13 
 
 		 482 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  40.13 
 
 		 482 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  38.35 
 
 		 480 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  36.38 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  36.38 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  36.38 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  37.16 
 
 		 486 aa  255  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  38.76 
 
 		 479 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  39.26 
 
 		 479 aa  245  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  37.5 
 
 		 486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  36.97 
 
 		 479 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  40.44 
 
 		 488 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  40.67 
 
 		 471 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  38.41 
 
 		 483 aa  236  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  37.78 
 
 		 467 aa  236  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  38.48 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  38.85 
 
 		 469 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  38.98 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  35.28 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  35.04 
 
 		 467 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  36.41 
 
 		 470 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  36.41 
 
 		 470 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  36.41 
 
 		 470 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  36.16 
 
 		 461 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  34.88 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  36.41 
 
 		 470 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  35.9 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  34.88 
 
 		 469 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  35.9 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  34.88 
 
 		 469 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  35.9 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  35.9 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  35.66 
 
 		 470 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  35.51 
 
 		 463 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  35.58 
 
 		 469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  35.41 
 
 		 470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  33.85 
 
 		 467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  33.55 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  33.26 
 
 		 467 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  34.1 
 
 		 474 aa  179  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  34.11 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  31.51 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  34.73 
 
 		 455 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  28.23 
 
 		 499 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  34.32 
 
 		 456 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  35.06 
 
 		 457 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  33.26 
 
 		 470 aa  173  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  35.43 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  32.9 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  32.64 
 
 		 445 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  33.15 
 
 		 445 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  35.56 
 
 		 497 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  35.41 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  31.48 
 
 		 467 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 500 aa  166  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  32.31 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  33.26 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  32.92 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  34.66 
 
 		 470 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  33.17 
 
 		 454 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  32.82 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  32.07 
 
 		 454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  32.67 
 
 		 473 aa  156  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  30.89 
 
 		 455 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  30.89 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  30.77 
 
 		 453 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  28.94 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  28.6 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  27.13 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 503 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  26.06 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  27.86 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  27.64 
 
 		 473 aa  100  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  29.09 
 
 		 476 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 468 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 468 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 468 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 466 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.82 
 
 		 468 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 474 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  28.45 
 
 		 471 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  28.45 
 
 		 471 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  28.45 
 
 		 471 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 483 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 465 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>